275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1442 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
152 aa  313  5e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  86.18 
 
 
152 aa  268  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.28 
 
 
148 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  38.73 
 
 
148 aa  88.6  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  36.81 
 
 
154 aa  84.7  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 
286 aa  81.6  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.57 
 
 
141 aa  79.3  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  35.77 
 
 
154 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.22 
 
 
145 aa  79  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.78 
 
 
289 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  32.85 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.09 
 
 
285 aa  73.2  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  33.12 
 
 
292 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  34.56 
 
 
141 aa  71.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.16 
 
 
136 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.33 
 
 
145 aa  70.5  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
287 aa  68.9  0.00000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
287 aa  68.6  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  33.09 
 
 
288 aa  68.6  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.1 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.07 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.33 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  32.59 
 
 
148 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
138 aa  65.9  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  32.81 
 
 
287 aa  65.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  34.81 
 
 
148 aa  65.1  0.0000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  37.88 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.35 
 
 
159 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  32.12 
 
 
289 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  32.59 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.04 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.47 
 
 
150 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  29.71 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  30.43 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 
155 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.71 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.12 
 
 
134 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.53 
 
 
155 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.71 
 
 
150 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  31.11 
 
 
160 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.16 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.86 
 
 
134 aa  61.2  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.2 
 
 
135 aa  60.8  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  32.35 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  32.35 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
139 aa  60.8  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  32.35 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  32.35 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  32.35 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  32.35 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.58 
 
 
131 aa  60.5  0.000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  32.35 
 
 
164 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  30.66 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.93 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.23 
 
 
133 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.31 
 
 
128 aa  59.3  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.84 
 
 
142 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
146 aa  58.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.08 
 
 
134 aa  58.9  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.43 
 
 
159 aa  58.9  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.93 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.35 
 
 
136 aa  57.4  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
129 aa  57  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.48 
 
 
145 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
136 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  28.1 
 
 
142 aa  56.6  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  30.15 
 
 
140 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
136 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.84 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.22 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  32.09 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  29.84 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.84 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
143 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.84 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.84 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.65 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.84 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.94 
 
 
149 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.27 
 
 
140 aa  56.2  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 
159 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  29.84 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.84 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.84 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 
146 aa  55.1  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
152 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  28.23 
 
 
136 aa  55.5  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  29.92 
 
 
145 aa  55.1  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>