260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0557 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
129 aa  260  3e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 
140 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.71 
 
 
145 aa  84.3  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 
139 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.76 
 
 
145 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  38.69 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.89 
 
 
285 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  35.54 
 
 
289 aa  75.9  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
287 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
287 aa  73.9  0.0000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
141 aa  73.9  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 
149 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  43.94 
 
 
140 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  36.3 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  31.93 
 
 
288 aa  67.8  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.59 
 
 
148 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  30.91 
 
 
138 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  33.9 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
287 aa  66.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  33.62 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
292 aa  64.3  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  33.85 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1329  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 
133 aa  63.5  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.866642  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  31.4 
 
 
154 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
148 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  31.4 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.71 
 
 
289 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.81 
 
 
135 aa  61.6  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1979  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
136 aa  60.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105854  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.05 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2577  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
192 aa  58.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  30.08 
 
 
287 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.69 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.8 
 
 
141 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
132 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
152 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1853  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0107665  normal  0.755502 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.05 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.05 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2232  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
134 aa  55.5  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
137 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
137 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.33 
 
 
131 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
152 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.71 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 
161 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 
161 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  26.45 
 
 
133 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  26.83 
 
 
134 aa  53.9  0.0000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  24.41 
 
 
146 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.68 
 
 
128 aa  53.5  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0841  thioesterase superfamily protein  23.02 
 
 
131 aa  53.1  0.000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  26.27 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.43 
 
 
161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.27 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  30.11 
 
 
145 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.82 
 
 
161 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.19 
 
 
132 aa  52.4  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2735  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.72 
 
 
132 aa  52  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234099  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.57 
 
 
153 aa  52.8  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.24 
 
 
140 aa  52  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.42 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.42 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.58 
 
 
139 aa  51.6  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.42 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.42 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.42 
 
 
139 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.63 
 
 
136 aa  51.6  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 
128 aa  51.6  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  25.41 
 
 
146 aa  52  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1590  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
144 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.228465  hitchhiker  0.00903187 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
149 aa  51.2  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.42 
 
 
139 aa  51.2  0.000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  35.29 
 
 
152 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  28.42 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 
134 aa  50.8  0.000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
140 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
149 aa  50.4  0.000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.61 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.5 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2090  hypothetical protein  30.12 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000228869  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 
155 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  27.45 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.74 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.74 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  25.22 
 
 
132 aa  49.7  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.43 
 
 
133 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
136 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>