More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2735 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
137 aa  286  5.0000000000000004e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  74.07 
 
 
136 aa  213  5e-55  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  75.56 
 
 
136 aa  209  9e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  70.45 
 
 
144 aa  201  3e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  66.17 
 
 
137 aa  190  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  62.12 
 
 
143 aa  176  8e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  51.26 
 
 
140 aa  111  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  51.26 
 
 
140 aa  110  7.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  43.1 
 
 
138 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  46.4 
 
 
137 aa  108  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  41.98 
 
 
146 aa  104  4e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  41.94 
 
 
139 aa  104  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 
137 aa  102  1e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.67 
 
 
138 aa  102  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  45.38 
 
 
136 aa  102  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  43.44 
 
 
144 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.26 
 
 
159 aa  100  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  42.5 
 
 
149 aa  100  6e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.03 
 
 
149 aa  99.8  1e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.6 
 
 
150 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  41.6 
 
 
138 aa  97.8  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.6 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  41.6 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  40.65 
 
 
145 aa  96.7  9e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  46.15 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.84 
 
 
149 aa  96.3  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.97 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.44 
 
 
141 aa  95.9  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.02 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.44 
 
 
159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.8 
 
 
150 aa  94.4  4e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.48 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.21 
 
 
139 aa  94.4  5e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.48 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.19 
 
 
161 aa  94  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.65 
 
 
134 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  39.2 
 
 
148 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  42.06 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.59 
 
 
161 aa  91.7  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  40.15 
 
 
164 aa  91.3  4e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  40.15 
 
 
164 aa  90.9  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  40.77 
 
 
161 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  40.77 
 
 
161 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  40.77 
 
 
161 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  40.77 
 
 
161 aa  90.5  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  40.15 
 
 
164 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  36.29 
 
 
155 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 
134 aa  90.5  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.29 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  41.74 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  37.19 
 
 
126 aa  90.1  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  38.4 
 
 
148 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 
145 aa  89.4  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  38.1 
 
 
144 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
128 aa  89.4  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  39.47 
 
 
133 aa  89  2e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.48 
 
 
161 aa  88.2  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
131 aa  88.2  3e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.48 
 
 
150 aa  88.2  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  36.44 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  36.44 
 
 
131 aa  87.8  4e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.9 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  39.52 
 
 
138 aa  87.8  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.1 
 
 
135 aa  87.4  6e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.27 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.27 
 
 
161 aa  87.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.74 
 
 
134 aa  87  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  38.71 
 
 
138 aa  87  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  36.51 
 
 
130 aa  86.7  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
141 aa  86.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.13 
 
 
138 aa  86.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  36.13 
 
 
155 aa  85.9  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.4 
 
 
136 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.81 
 
 
145 aa  85.1  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.24 
 
 
140 aa  84.3  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.32 
 
 
134 aa  84  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  34.19 
 
 
138 aa  84  7e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  40.34 
 
 
141 aa  83.6  7e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  37.4 
 
 
134 aa  83.6  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  36.84 
 
 
134 aa  83.6  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  39.06 
 
 
139 aa  82.8  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.75 
 
 
127 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.8 
 
 
150 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.21 
 
 
132 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.75 
 
 
115 aa  82.4  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.29 
 
 
136 aa  82.8  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  35.25 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  35.25 
 
 
155 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  33.33 
 
 
133 aa  81.6  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  38.18 
 
 
145 aa  81.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  37.5 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
146 aa  80.5  0.000000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.61 
 
 
137 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.9 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
139 aa  78.6  0.00000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.48 
 
 
140 aa  79  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>