More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_2936 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
131 aa  271  2.0000000000000002e-72  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  42.74 
 
 
149 aa  105  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  38.52 
 
 
140 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  37.9 
 
 
140 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.62 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
144 aa  97.8  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 
138 aa  97.1  7e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  37.72 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.89 
 
 
140 aa  95.9  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 
143 aa  94  7e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  36.59 
 
 
145 aa  93.6  9e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
146 aa  90.9  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  45.05 
 
 
134 aa  90.1  8e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
145 aa  89.7  1e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  40.54 
 
 
139 aa  88.2  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.07 
 
 
137 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.5 
 
 
127 aa  87  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.07 
 
 
136 aa  87  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  36 
 
 
133 aa  85.9  2e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  34.68 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  34.35 
 
 
136 aa  84.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.75 
 
 
149 aa  84  6e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
137 aa  84  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.59 
 
 
129 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
133 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 
145 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  38.04 
 
 
138 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.54 
 
 
133 aa  82  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  36.21 
 
 
136 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.08 
 
 
150 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.68 
 
 
136 aa  80.9  0.000000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
139 aa  80.5  0.000000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 
128 aa  80.1  0.000000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
166 aa  79.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
138 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  35.78 
 
 
138 aa  79  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.8 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  37.07 
 
 
144 aa  77.8  0.00000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  32.8 
 
 
132 aa  78.2  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.06 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
139 aa  77.4  0.00000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.43 
 
 
161 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  34.41 
 
 
141 aa  77  0.00000000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.16 
 
 
134 aa  77  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.58 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.88 
 
 
143 aa  76.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.43 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.88 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  36.11 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.06 
 
 
153 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.05 
 
 
134 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.85 
 
 
159 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.29 
 
 
132 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  33.33 
 
 
134 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.04 
 
 
139 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  34.45 
 
 
137 aa  74.3  0.0000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 
139 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  30.97 
 
 
135 aa  73.9  0.0000000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
135 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2827  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
149 aa  73.9  0.0000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.86 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.73 
 
 
138 aa  73.6  0.0000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.93 
 
 
134 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1211  thioesterase superfamily protein  33.64 
 
 
153 aa  73.6  0.0000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.43 
 
 
159 aa  72  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  33.02 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.03 
 
 
141 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  33.33 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.85 
 
 
133 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.68 
 
 
148 aa  72.4  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  31.19 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
142 aa  72.8  0.000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.86 
 
 
136 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  31.19 
 
 
155 aa  72.4  0.000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.28 
 
 
137 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  31.9 
 
 
136 aa  71.6  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.52 
 
 
146 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.24 
 
 
115 aa  71.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.79 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.79 
 
 
161 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  33.88 
 
 
130 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.5 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.43 
 
 
159 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>