More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_1073 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  100 
 
 
145 aa  298  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  58.4 
 
 
139 aa  147  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  51.61 
 
 
136 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  49.62 
 
 
134 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  52.55 
 
 
139 aa  140  6e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  51.72 
 
 
138 aa  133  9.999999999999999e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  41.26 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
145 aa  110  4.0000000000000004e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  41.41 
 
 
133 aa  110  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  42.98 
 
 
133 aa  105  1e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  39.86 
 
 
146 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  36.09 
 
 
155 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  36.09 
 
 
155 aa  100  9e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.41 
 
 
149 aa  99.4  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 
137 aa  98.6  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.65 
 
 
137 aa  96.7  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
138 aa  96.3  1e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 
144 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
131 aa  93.6  9e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  40.17 
 
 
138 aa  92.8  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 
139 aa  92.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
155 aa  92  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
139 aa  91.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  41.67 
 
 
136 aa  91.3  4e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  35.34 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.09 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.34 
 
 
139 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.59 
 
 
139 aa  90.9  6e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.59 
 
 
139 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.34 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.34 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.34 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.34 
 
 
139 aa  90.1  8e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  41.59 
 
 
136 aa  89  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  33.8 
 
 
149 aa  88.6  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03885  hypothetical protein  34.85 
 
 
157 aa  88.2  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  37.7 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
142 aa  87.8  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  37.19 
 
 
145 aa  87  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.61 
 
 
138 aa  87  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  41.11 
 
 
135 aa  86.3  1e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
146 aa  83.6  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  40.48 
 
 
138 aa  83.2  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  39.17 
 
 
136 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  37.29 
 
 
137 aa  81.6  0.000000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4502  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.71 
 
 
161 aa  81.3  0.000000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  38.02 
 
 
143 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  39.8 
 
 
137 aa  80.1  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
138 aa  77.4  0.00000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1596  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
149 aa  76.6  0.0000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000186946 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
140 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
135 aa  75.5  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.82 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
140 aa  74.7  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.82 
 
 
133 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.33 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
139 aa  72.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.67 
 
 
134 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  32.77 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  32.77 
 
 
131 aa  71.6  0.000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.4 
 
 
134 aa  72  0.000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.8 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  32.8 
 
 
132 aa  71.6  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
144 aa  71.6  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
129 aa  71.2  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.6 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 
161 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 
162 aa  71.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  26.15 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.6 
 
 
134 aa  70.5  0.000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  28.66 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3139  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.51 
 
 
166 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  30.16 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.61 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.59 
 
 
136 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0641  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
165 aa  69.7  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.617433  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  28.66 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  28.66 
 
 
161 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  28.66 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.6 
 
 
134 aa  69.7  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  28.66 
 
 
164 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  28.66 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  28.66 
 
 
161 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.36 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
166 aa  67.4  0.00000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  32.48 
 
 
128 aa  67  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.2 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  27.91 
 
 
144 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.68 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0701  hypothetical protein  25 
 
 
153 aa  66.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00299166  normal  0.252492 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.6 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>