More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3461 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  100 
 
 
130 aa  259  8.999999999999999e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  80 
 
 
137 aa  204  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  79.2 
 
 
128 aa  201  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  69.6 
 
 
127 aa  185  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  61.83 
 
 
133 aa  168  3e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  62.81 
 
 
133 aa  165  2e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  56.49 
 
 
131 aa  152  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  45 
 
 
134 aa  114  5e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  44.17 
 
 
134 aa  111  4.0000000000000004e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  110  6e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.5 
 
 
134 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.67 
 
 
133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.67 
 
 
133 aa  109  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  44.17 
 
 
134 aa  108  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
134 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
134 aa  107  5e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  107  5e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  43.33 
 
 
134 aa  107  5e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  107  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  107  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  107  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  107  5e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  107  5e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.62 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.62 
 
 
140 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  105  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.97 
 
 
129 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  44 
 
 
131 aa  103  7e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  43.33 
 
 
134 aa  103  8e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  37.6 
 
 
129 aa  103  8e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.8 
 
 
151 aa  103  9e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.44 
 
 
150 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.09 
 
 
154 aa  102  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.48 
 
 
134 aa  102  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.72 
 
 
150 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.44 
 
 
133 aa  101  3e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44 
 
 
159 aa  102  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.72 
 
 
144 aa  101  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.06 
 
 
143 aa  100  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  44.44 
 
 
150 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.09 
 
 
150 aa  100  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.44 
 
 
150 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.98 
 
 
151 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.06 
 
 
155 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
142 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.8 
 
 
161 aa  99.4  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  43.55 
 
 
160 aa  99.8  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.8 
 
 
124 aa  99.8  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.65 
 
 
150 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.94 
 
 
148 aa  99  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.06 
 
 
141 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.4 
 
 
159 aa  99.4  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.8 
 
 
161 aa  99.4  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  41.27 
 
 
155 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.9 
 
 
155 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.44 
 
 
147 aa  98.2  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.8 
 
 
161 aa  98.2  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  42.86 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 
132 aa  97.4  5e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.8 
 
 
161 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.8 
 
 
161 aa  97.4  5e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  43.55 
 
 
164 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  43.55 
 
 
164 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  43.55 
 
 
161 aa  97.4  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.4 
 
 
161 aa  97.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  42.31 
 
 
137 aa  97.4  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  43.55 
 
 
164 aa  97.4  6e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  43.55 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  43.55 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  43.55 
 
 
161 aa  97.1  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
133 aa  97.1  8e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.68 
 
 
140 aa  96.7  9e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  42.52 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.6 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.4 
 
 
159 aa  96.3  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  46.09 
 
 
134 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  42.74 
 
 
148 aa  95.9  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  42.5 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2542  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000475401  hitchhiker  0.00000263931 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  39.13 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  39.13 
 
 
131 aa  95.5  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.6 
 
 
145 aa  95.5  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.44 
 
 
128 aa  95.5  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.33 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.16 
 
 
132 aa  95.9  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.8 
 
 
136 aa  94.7  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.97 
 
 
139 aa  94.7  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.5 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000193862  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2535  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.5 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000842763  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36680  acyl-coenzyme A thioester hydrolase  43.85 
 
 
148 aa  94.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.853983  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.28 
 
 
169 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.8 
 
 
132 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.5 
 
 
133 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  42.74 
 
 
148 aa  94  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>