More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1215 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  100 
 
 
134 aa  268  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  47.73 
 
 
166 aa  120  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48 
 
 
136 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  48.03 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  48.03 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  48.03 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  48.03 
 
 
164 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  48.03 
 
 
164 aa  115  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  48.03 
 
 
164 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  48.03 
 
 
161 aa  115  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.39 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.39 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48.39 
 
 
161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  48.39 
 
 
161 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48.39 
 
 
161 aa  110  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.58 
 
 
161 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.92 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.28 
 
 
159 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  49.06 
 
 
160 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.34 
 
 
141 aa  107  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.35 
 
 
134 aa  106  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.45 
 
 
159 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.88 
 
 
134 aa  104  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.29 
 
 
153 aa  103  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  45.38 
 
 
132 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.38 
 
 
132 aa  103  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.51 
 
 
143 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.67 
 
 
135 aa  102  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.83 
 
 
143 aa  102  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  48.08 
 
 
134 aa  102  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  48.08 
 
 
134 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.01 
 
 
150 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.31 
 
 
149 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.26 
 
 
133 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.12 
 
 
134 aa  100  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.06 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.75 
 
 
150 aa  99  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.19 
 
 
129 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  46.92 
 
 
132 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.06 
 
 
145 aa  98.6  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.96 
 
 
143 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.08 
 
 
151 aa  97.4  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  47.2 
 
 
150 aa  97.4  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  44.72 
 
 
147 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  42.4 
 
 
126 aa  95.9  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.41 
 
 
139 aa  95.9  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  42.02 
 
 
141 aa  95.1  3e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  46.73 
 
 
134 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.97 
 
 
140 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.97 
 
 
140 aa  94  7e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.98 
 
 
124 aa  94  7e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.44 
 
 
151 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6904  thioesterase superfamily protein  39.26 
 
 
149 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0171127  normal  0.306193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  45.79 
 
 
134 aa  92  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  43.85 
 
 
135 aa  92  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  42.74 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  40.68 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4057  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.09 
 
 
140 aa  91.3  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.74 
 
 
149 aa  91.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.09 
 
 
133 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.09 
 
 
133 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000193862  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2535  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.09 
 
 
133 aa  90.9  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000842763  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2889  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.65 
 
 
158 aa  90.9  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.992552  normal  0.218696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.09 
 
 
133 aa  90.9  6e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.59 
 
 
142 aa  90.5  7e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.27 
 
 
153 aa  90.5  8e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.35 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  40.32 
 
 
144 aa  90.1  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.09 
 
 
133 aa  90.1  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.93 
 
 
134 aa  89.4  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  45.08 
 
 
150 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  43.22 
 
 
143 aa  89  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.08 
 
 
150 aa  89  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.31 
 
 
148 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  43.24 
 
 
140 aa  88.6  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  41.53 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  41.91 
 
 
128 aa  88.6  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  50 
 
 
130 aa  88.6  3e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.54 
 
 
133 aa  88.6  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.54 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.83 
 
 
132 aa  88.6  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  45.54 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.54 
 
 
133 aa  88.2  3e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  40.16 
 
 
141 aa  88.6  3e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  43.33 
 
 
134 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  44.27 
 
 
140 aa  87.8  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.99 
 
 
134 aa  88.2  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
139 aa  87.8  5e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  42.99 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.99 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.06 
 
 
133 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  42.99 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  38.35 
 
 
152 aa  87.4  6e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.99 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.99 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.99 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.99 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.06 
 
 
133 aa  87.4  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  42.99 
 
 
134 aa  87.4  6e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>