196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1916 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 		 128 aa  263  4e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  54.62 
 
 		 133 aa  135  1e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  50 
 
 		 135 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  49.14 
 
 		 141 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  50.85 
 
 		 130 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  45.74 
 
 		 138 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  50 
 
 		 132 aa  115  1.9999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 		 138 aa  114  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  49.22 
 
 		 139 aa  115  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  48.82 
 
 		 134 aa  114  6e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  43.97 
 
 		 132 aa  114  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  49.56 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  43.59 
 
 		 139 aa  101  3e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  36.15 
 
 		 145 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  36.15 
 
 		 167 aa  77.4  0.00000000000006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  37.9 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 		 128 aa  63.5  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.92 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  34.31 
 
 		 152 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.23 
 
 		 137 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  33.06 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  37 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  35.77 
 
 		 146 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1390  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.84 
 
 		 132 aa  56.6  0.0000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00302966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.4 
 
 		 141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1170  hypothetical protein  34.19 
 
 		 128 aa  55.8  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.456722  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.54 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.84 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.02 
 
 		 145 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  31.93 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  34.82 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0643  hypothetical protein  35.59 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  34.29 
 
 		 152 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  27.68 
 
 		 129 aa  53.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  34.95 
 
 		 160 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 		 161 aa  53.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.8 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 139 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  30.43 
 
 		 154 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.46 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.45 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2560  hypothetical protein  28.16 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2613  hypothetical protein  28.16 
 
 		 136 aa  52.8  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 		 138 aa  52  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  32.63 
 
 		 139 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 		 132 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 137 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.46 
 
 		 134 aa  50.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1107  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 		 136 aa  50.8  0.000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0129163  normal  0.667766 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.85 
 
 		 135 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  35.42 
 
 		 134 aa  50.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  33.98 
 
 		 164 aa  50.4  0.000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  32.98 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  33.98 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  33.98 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.07 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  28 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  29.9 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  33.98 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.4 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  33.98 
 
 		 161 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 149 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  33.98 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  33.98 
 
 		 164 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.76 
 
 		 161 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2735  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.92 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.234099  hitchhiker  0.000101572 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0474  hypothetical protein  35.14 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.637818  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  33.86 
 
 		 155 aa  48.9  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.9 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.9 
 
 		 161 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.42 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2184  thioesterase superfamily protein  27.59 
 
 		 147 aa  48.9  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.315338  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 		 132 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  35.8 
 
 		 140 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.23 
 
 		 149 aa  48.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.01 
 
 		 161 aa  48.9  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.71 
 
 		 148 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 		 133 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3458  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 146 aa  48.1  0.00004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.93 
 
 		 133 aa  47.8  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 		 285 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 159 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  30.1 
 
 		 149 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.5 
 
 		 133 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 136 aa  47.4  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 144 aa  47  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.57 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.81 
 
 		 289 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 		 159 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3609  hypothetical protein  27.56 
 
 		 142 aa  47  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.68702  hitchhiker  0.000160663 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>