More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE2225 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  100 
 
 		 135 aa  280  5.000000000000001e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  34.09 
 
 		 133 aa  79.3  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  36.07 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1444  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 129 aa  72.8  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.084624  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 		 141 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  35.71 
 
 		 135 aa  72.4  0.000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.9 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 137 aa  72  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.67 
 
 		 133 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 138 aa  70.9  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.83 
 
 		 133 aa  70.1  0.000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.22 
 
 		 149 aa  69.3  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.33 
 
 		 137 aa  69.3  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  35.2 
 
 		 144 aa  68.6  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  34.55 
 
 		 134 aa  67  0.00000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  34.21 
 
 		 132 aa  67  0.00000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.666839 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  39.25 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  39.25 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  39.25 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  39.25 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  39.25 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  39.25 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  39.25 
 
 		 132 aa  67  0.00000000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.61 
 
 		 127 aa  66.6  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  34.58 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  39.25 
 
 		 132 aa  66.2  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  37.38 
 
 		 132 aa  65.5  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.55 
 
 		 132 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 134 aa  64.7  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.2 
 
 		 148 aa  64.3  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28.8 
 
 		 132 aa  63.5  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  33.61 
 
 		 138 aa  63.5  0.0000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2484  hypothetical protein  31.4 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.838963  normal  0.0924158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 156 aa  63.2  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 137 aa  62.8  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 142 aa  62.8  0.000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.51 
 
 		 124 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 136 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  35.45 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1458  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.64 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0173247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  30 
 
 		 130 aa  61.6  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 136 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  31.25 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 131 aa  60.8  0.000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  33.03 
 
 		 132 aa  59.7  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.51 
 
 		 128 aa  59.7  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  33.06 
 
 		 133 aa  58.9  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 128 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 142 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  31.3 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 		 135 aa  58.9  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  30 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.45 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.8 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  31.3 
 
 		 135 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.35 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 138 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 		 138 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 151 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.75 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  28.69 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  30.65 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2568  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.63 
 
 		 157 aa  55.1  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331427  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  32.17 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.56 
 
 		 135 aa  55.1  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  30 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 137 aa  54.7  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.21 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.35 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  29.08 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  31.15 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2694  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.107372  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.23 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  31.45 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 		 155 aa  53.9  0.0000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  33.33 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 		 144 aa  53.5  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.5 
 
 		 151 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.5 
 
 		 139 aa  52.8  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.39 
 
 		 150 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.43 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  27.19 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>