More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4734 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
138 aa  283  7e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  92.65 
 
 
136 aa  259  1e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  33.88 
 
 
203 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
145 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  34.38 
 
 
130 aa  73.6  0.000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
142 aa  72  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
145 aa  71.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
147 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 
145 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.8 
 
 
134 aa  69.3  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  34.71 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
162 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.93 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  31.9 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  31.9 
 
 
125 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 
145 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  31.9 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  31.9 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  31.9 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  31.9 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  31.9 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.58 
 
 
149 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.08 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  28.68 
 
 
149 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
144 aa  65.1  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
148 aa  64.7  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
153 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51770  hypothetical protein  31.75 
 
 
148 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000185409 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  32.5 
 
 
153 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 
133 aa  63.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4540  hypothetical protein  32.54 
 
 
148 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.81 
 
 
159 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
138 aa  63.5  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
160 aa  62.8  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
128 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 
150 aa  61.6  0.000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
153 aa  61.6  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.81 
 
 
159 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 
140 aa  61.2  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  30.53 
 
 
135 aa  61.2  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.2 
 
 
150 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2118  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 
153 aa  61.2  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 
134 aa  60.5  0.000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
152 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 
155 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.4 
 
 
142 aa  60.1  0.000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 
145 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
164 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 
175 aa  60.1  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.25 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 
136 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
149 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  30.4 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
149 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.66 
 
 
145 aa  59.3  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  31.09 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  30.25 
 
 
134 aa  58.2  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
157 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 
159 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 
131 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  32.79 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
152 aa  57.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  32.26 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  32.26 
 
 
131 aa  57.4  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4406  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.71 
 
 
155 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0255254  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  31.5 
 
 
164 aa  57.4  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  26.98 
 
 
154 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  30.17 
 
 
147 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  30.71 
 
 
160 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.25 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.25 
 
 
133 aa  57  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
137 aa  57  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.17 
 
 
115 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 
287 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  30.71 
 
 
161 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>