240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4741 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
153 aa  315  2e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  77.03 
 
 
164 aa  244  2e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  78.72 
 
 
162 aa  235  1e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  78.01 
 
 
162 aa  234  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  78.36 
 
 
160 aa  227  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  77.21 
 
 
188 aa  226  8e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  68.71 
 
 
147 aa  214  2e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  70.92 
 
 
145 aa  213  5e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  70.92 
 
 
145 aa  213  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  70.42 
 
 
203 aa  213  7e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  70.92 
 
 
145 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  70.92 
 
 
145 aa  213  9e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  71.72 
 
 
147 aa  212  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  72 
 
 
155 aa  212  1.9999999999999998e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  69.5 
 
 
145 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  68.53 
 
 
175 aa  210  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  71.32 
 
 
149 aa  209  7.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  68.79 
 
 
145 aa  209  2e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  71.11 
 
 
181 aa  207  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  71.11 
 
 
181 aa  207  3e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  71.11 
 
 
149 aa  207  4e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  71.11 
 
 
149 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  71.11 
 
 
149 aa  207  4e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 
150 aa  206  6e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  66.67 
 
 
149 aa  203  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  70.21 
 
 
163 aa  202  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  72.52 
 
 
153 aa  201  2e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  65.96 
 
 
149 aa  201  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  69.85 
 
 
147 aa  196  7e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  69.85 
 
 
147 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  68.09 
 
 
145 aa  190  5e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  65.65 
 
 
142 aa  186  1e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  60.28 
 
 
144 aa  182  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  74.34 
 
 
125 aa  181  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  64.54 
 
 
145 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  54.55 
 
 
148 aa  179  9.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  60.9 
 
 
147 aa  178  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  57.64 
 
 
147 aa  176  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  58.52 
 
 
143 aa  176  1e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  59.57 
 
 
153 aa  175  2e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  60.87 
 
 
153 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  59.42 
 
 
153 aa  171  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  60.74 
 
 
150 aa  164  4e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  54.48 
 
 
150 aa  162  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  56.83 
 
 
142 aa  161  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  52.99 
 
 
150 aa  160  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  53.73 
 
 
142 aa  159  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  51.13 
 
 
136 aa  159  2e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  51.7 
 
 
156 aa  158  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  53.57 
 
 
150 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 
137 aa  156  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 
148 aa  154  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  56.03 
 
 
143 aa  151  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  56.03 
 
 
143 aa  152  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  50.7 
 
 
143 aa  152  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  47.33 
 
 
155 aa  149  2e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  51.88 
 
 
137 aa  147  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 
143 aa  147  6e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  47.79 
 
 
138 aa  143  8.000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  49.22 
 
 
145 aa  140  8e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  50.41 
 
 
147 aa  132  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  44.68 
 
 
151 aa  130  9e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  47.62 
 
 
149 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
146 aa  111  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  35.14 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  34.21 
 
 
169 aa  108  3e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  37.41 
 
 
146 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 
146 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  39.42 
 
 
151 aa  97.1  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  28.15 
 
 
156 aa  80.5  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  26.75 
 
 
156 aa  79.7  0.00000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  33.58 
 
 
138 aa  77.8  0.00000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
146 aa  64.3  0.0000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  29.5 
 
 
154 aa  63.9  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  30.33 
 
 
137 aa  63.2  0.000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  36.07 
 
 
134 aa  63.5  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
161 aa  62  0.000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  26.5 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  29.37 
 
 
288 aa  60.5  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
135 aa  60.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 
139 aa  60.5  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  29.71 
 
 
154 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
136 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
139 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  30.43 
 
 
289 aa  59.7  0.00000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
286 aa  58.9  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  31.34 
 
 
287 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
136 aa  58.2  0.00000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.62 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.62 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.62 
 
 
148 aa  57.8  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>