194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3281 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  100 
 
 		 150 aa  306  5e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  82.86 
 
 		 143 aa  234  3e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  82.14 
 
 		 143 aa  233  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  58.57 
 
 		 175 aa  179  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  54.86 
 
 		 148 aa  178  2e-44  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  63.19 
 
 		 145 aa  177  4.999999999999999e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 		 145 aa  174  5e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  58.09 
 
 		 147 aa  172  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  57.35 
 
 		 147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  57.93 
 
 		 153 aa  170  5.999999999999999e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  57.24 
 
 		 153 aa  170  6.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  54.29 
 
 		 164 aa  169  9e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  58.04 
 
 		 153 aa  168  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  56.03 
 
 		 149 aa  166  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  57.25 
 
 		 181 aa  164  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  57.25 
 
 		 181 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  56.16 
 
 		 145 aa  164  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  57.25 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  57.25 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  57.25 
 
 		 149 aa  164  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  56.25 
 
 		 203 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  57.25 
 
 		 149 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  55.48 
 
 		 145 aa  163  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  55.48 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  55.48 
 
 		 145 aa  162  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  55.48 
 
 		 145 aa  161  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  54.79 
 
 		 145 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  55.48 
 
 		 163 aa  160  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  59.54 
 
 		 153 aa  160  7e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  53.47 
 
 		 147 aa  159  1e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  53.57 
 
 		 153 aa  156  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  56.62 
 
 		 160 aa  155  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 147 aa  156  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 		 149 aa  155  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 		 162 aa  153  8e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  55 
 
 		 150 aa  153  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 144 aa  152  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  56.1 
 
 		 136 aa  152  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 		 162 aa  152  2e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  53.44 
 
 		 142 aa  150  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  53.19 
 
 		 155 aa  150  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  52.94 
 
 		 142 aa  148  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  52.14 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  51.85 
 
 		 143 aa  146  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  51.09 
 
 		 148 aa  145  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  54.07 
 
 		 188 aa  143  7.0000000000000006e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  47.92 
 
 		 143 aa  142  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  59.65 
 
 		 125 aa  140  4e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  49.29 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  49.29 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  49.29 
 
 		 147 aa  140  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  51.77 
 
 		 147 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 138 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  50.72 
 
 		 137 aa  138  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  53.38 
 
 		 147 aa  136  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  47.62 
 
 		 142 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  48.55 
 
 		 155 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  46.1 
 
 		 151 aa  130  6e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  47.92 
 
 		 150 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  47.76 
 
 		 150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  47.48 
 
 		 143 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  47.41 
 
 		 137 aa  129  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  47.69 
 
 		 150 aa  125  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  45.16 
 
 		 145 aa  123  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  44.14 
 
 		 143 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  44.52 
 
 		 149 aa  118  3e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  33.56 
 
 		 169 aa  91.7  3e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 146 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  31.65 
 
 		 146 aa  80.5  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  33.81 
 
 		 151 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  35.38 
 
 		 146 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  30.6 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  26.87 
 
 		 156 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  30.4 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 149 aa  60.5  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  26.28 
 
 		 161 aa  60.1  0.000000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 161 aa  60.5  0.000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  25.58 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  29.84 
 
 		 137 aa  59.3  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 		 287 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  32.14 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  31.97 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  28.1 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 135 aa  57.4  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 		 180 aa  57  0.00000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 144 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  34.13 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  26.45 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  30.36 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  27.27 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  27.46 
 
 		 150 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  25.62 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  28.15 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  26.23 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>