245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0815 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
139 aa  292  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  51.52 
 
 
140 aa  157  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
139 aa  147  6e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  47.73 
 
 
140 aa  145  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  44.2 
 
 
140 aa  141  3e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  44.7 
 
 
139 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  45.45 
 
 
156 aa  138  1.9999999999999998e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 
147 aa  137  3e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  49.61 
 
 
136 aa  134  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  47.24 
 
 
142 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  48.03 
 
 
133 aa  120  4e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 
143 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 
143 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 
143 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  46.72 
 
 
147 aa  115  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  46.03 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  46.67 
 
 
134 aa  114  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  48.36 
 
 
159 aa  114  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  45.24 
 
 
133 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  48.36 
 
 
143 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  48.36 
 
 
143 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  48.36 
 
 
143 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  48.36 
 
 
143 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  48.36 
 
 
143 aa  114  6e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  48.36 
 
 
143 aa  114  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  47.01 
 
 
132 aa  113  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  47.83 
 
 
132 aa  113  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  43.55 
 
 
139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  35.16 
 
 
134 aa  105  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  34.38 
 
 
134 aa  105  3e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  46.6 
 
 
213 aa  97.1  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 
136 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 
135 aa  95.9  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  36.43 
 
 
130 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  36.43 
 
 
130 aa  90.1  8e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
139 aa  85.9  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  32.28 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  29.93 
 
 
161 aa  76.3  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 
148 aa  74.3  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  33.06 
 
 
137 aa  73.6  0.0000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  29.13 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
148 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
147 aa  72  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
135 aa  72  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 
148 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  28.12 
 
 
134 aa  71.6  0.000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.35 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  30.47 
 
 
136 aa  69.3  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
175 aa  67  0.00000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
145 aa  66.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  27.21 
 
 
153 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 
139 aa  65.1  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 
147 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 
140 aa  64.7  0.0000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  29.82 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
153 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  28.93 
 
 
145 aa  64.3  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  26.96 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
150 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  30.84 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  26.87 
 
 
150 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  29.75 
 
 
153 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
142 aa  62.8  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  30.23 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
137 aa  62  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  27.78 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
145 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
154 aa  62  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
145 aa  61.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
150 aa  61.6  0.000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
144 aa  61.2  0.000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
155 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  26.62 
 
 
154 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
145 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
142 aa  61.2  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  27.5 
 
 
143 aa  60.8  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.95 
 
 
142 aa  60.8  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  27.5 
 
 
143 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  44.83 
 
 
167 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>