240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1769 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 147 aa  306  5.9999999999999995e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  70.71 
 
 		 164 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  68.71 
 
 		 153 aa  214  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  68.03 
 
 		 147 aa  210  3.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  74.44 
 
 		 160 aa  211  3.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  70.34 
 
 		 203 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  72.99 
 
 		 181 aa  210  4.9999999999999996e-54  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  72.99 
 
 		 181 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  72.99 
 
 		 149 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  72.99 
 
 		 149 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  72.99 
 
 		 149 aa  210  5.999999999999999e-54  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  72.99 
 
 		 149 aa  209  1e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  68.03 
 
 		 155 aa  208  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 		 145 aa  206  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  65.99 
 
 		 145 aa  205  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  65.31 
 
 		 145 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  65.31 
 
 		 145 aa  204  5e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  66.21 
 
 		 145 aa  203  7e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  65.52 
 
 		 145 aa  201  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  70.59 
 
 		 188 aa  200  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  65.71 
 
 		 162 aa  197  3e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  66.2 
 
 		 145 aa  196  7e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  65 
 
 		 162 aa  196  7.999999999999999e-50  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  67.16 
 
 		 153 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  63.57 
 
 		 175 aa  195  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 		 163 aa  194  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  65.71 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  62.86 
 
 		 149 aa  191  4e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  65.89 
 
 		 142 aa  188  2e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 		 147 aa  187  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  61.7 
 
 		 144 aa  187  5.999999999999999e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  61.38 
 
 		 147 aa  186  9e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  60 
 
 		 149 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  62.86 
 
 		 150 aa  185  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  76.99 
 
 		 125 aa  184  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  62.33 
 
 		 153 aa  184  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  61.81 
 
 		 153 aa  181  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  59.18 
 
 		 153 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  52.45 
 
 		 148 aa  173  6e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  57.55 
 
 		 147 aa  173  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  56.52 
 
 		 143 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  54.42 
 
 		 147 aa  169  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  55.71 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  54.81 
 
 		 150 aa  164  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  53.33 
 
 		 150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  51.52 
 
 		 136 aa  160  7e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  52.17 
 
 		 155 aa  159  2e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  55.22 
 
 		 142 aa  158  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  52.14 
 
 		 150 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  52.24 
 
 		 137 aa  155  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  59.2 
 
 		 156 aa  154  3e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  55.3 
 
 		 150 aa  154  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  50.35 
 
 		 143 aa  150  7e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  48.85 
 
 		 142 aa  149  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  51.49 
 
 		 143 aa  149  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 		 143 aa  149  8e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  49.64 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 		 148 aa  147  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  50 
 
 		 145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  48.89 
 
 		 137 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  47.37 
 
 		 138 aa  144  3e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  43.15 
 
 		 151 aa  138  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  46.83 
 
 		 147 aa  130  5e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  42.66 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  42.96 
 
 		 149 aa  114  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  37.67 
 
 		 146 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  37.24 
 
 		 146 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  35.17 
 
 		 146 aa  110  6e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  36.55 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  32.09 
 
 		 169 aa  95.1  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 139 aa  79  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  27.66 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  26.76 
 
 		 156 aa  77.8  0.00000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 136 aa  75.9  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 136 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 146 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 161 aa  66.2  0.0000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 157 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  33.6 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  25.18 
 
 		 161 aa  62.8  0.000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 151 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  32 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.32 
 
 		 148 aa  62  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  31.78 
 
 		 147 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  28.86 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 		 136 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  30.16 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  32.03 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 142 aa  60.8  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 143 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 135 aa  60.8  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  30.08 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>