252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A1317 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
149 aa  307  2.9999999999999997e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  86.58 
 
 
149 aa  269  8.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  85.92 
 
 
150 aa  256  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  82.52 
 
 
145 aa  246  5e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  82.52 
 
 
145 aa  246  5e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  81.12 
 
 
145 aa  245  1e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  81.12 
 
 
145 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  80.99 
 
 
145 aa  243  4.9999999999999997e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  80.99 
 
 
145 aa  242  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  79.58 
 
 
203 aa  236  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  80.74 
 
 
181 aa  229  7.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  80.74 
 
 
181 aa  229  9e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  81.34 
 
 
149 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  81.34 
 
 
149 aa  229  1e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  81.34 
 
 
149 aa  228  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  81.34 
 
 
149 aa  229  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  72.79 
 
 
175 aa  224  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1902  thioesterase superfamily protein  78.87 
 
 
163 aa  221  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.119468 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  68.79 
 
 
164 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  72.99 
 
 
147 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  72.99 
 
 
147 aa  206  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  67.59 
 
 
162 aa  205  2e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  66.9 
 
 
162 aa  204  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  66.67 
 
 
153 aa  203  8e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  82.46 
 
 
125 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  68.09 
 
 
188 aa  194  3e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  65.25 
 
 
145 aa  194  4.0000000000000005e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1508  putative thioesterase  73.64 
 
 
153 aa  192  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0888126  normal  0.372254 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  64.08 
 
 
145 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  62.86 
 
 
147 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  62.5 
 
 
142 aa  187  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  60.14 
 
 
143 aa  187  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  63.31 
 
 
153 aa  187  5e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  62.59 
 
 
153 aa  186  9e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  66.17 
 
 
160 aa  186  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  60.56 
 
 
144 aa  185  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  61.43 
 
 
153 aa  183  9e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  61.97 
 
 
147 aa  181  4.0000000000000006e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0382  thioesterase superfamily protein  61.94 
 
 
143 aa  180  7e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  57.82 
 
 
147 aa  175  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1614  thioesterase superfamily protein  61.27 
 
 
155 aa  174  3e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153197  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  62.94 
 
 
150 aa  174  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68490  hypothetical protein  62.5 
 
 
147 aa  174  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.222508 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  52.86 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  59.12 
 
 
156 aa  171  2.9999999999999996e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2340  thioesterase superfamily protein  57.25 
 
 
148 aa  170  6.999999999999999e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.280619  normal  0.0595669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5015  thioesterase superfamily protein  59.7 
 
 
137 aa  168  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.168597  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37230  predicted thioesterase  55.56 
 
 
136 aa  166  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0929724 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3281  hypothetical protein  56.03 
 
 
150 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.704366  normal  0.549682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4906  thioesterase superfamily protein  58.21 
 
 
142 aa  164  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.825665  normal  0.173535 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  56.43 
 
 
143 aa  161  3e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  56.43 
 
 
143 aa  160  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6680  thioesterase  56.72 
 
 
142 aa  160  5.0000000000000005e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0588358  normal  0.343275 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5810  thioesterase superfamily protein  56.12 
 
 
143 aa  159  1e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  54.93 
 
 
150 aa  158  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1026  thioesterase superfamily protein  57.89 
 
 
137 aa  157  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  55.24 
 
 
150 aa  157  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  53.24 
 
 
155 aa  155  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4685  thioesterase superfamily protein  52.99 
 
 
138 aa  150  5.9999999999999996e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3146  thioesterase superfamily protein  51.11 
 
 
143 aa  146  7e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.433869  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04031  thioesterase family protein domain protein  48.51 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  49.63 
 
 
147 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  49.63 
 
 
147 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  49.63 
 
 
147 aa  137  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  46.81 
 
 
151 aa  135  2e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  48.25 
 
 
149 aa  127  5.0000000000000004e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0254  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
146 aa  114  5e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0152562 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0269  thioesterase superfamily protein  38.3 
 
 
146 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07356  thioesterase family protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16350)  35.03 
 
 
169 aa  105  1e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.374208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0279  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
146 aa  104  3e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4956  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
146 aa  104  4e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000294278 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1058  putative thioesterase  40 
 
 
151 aa  104  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  36.8 
 
 
134 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1238  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
156 aa  74.3  0.0000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.546619  normal  0.661464 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
146 aa  73.9  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
139 aa  71.6  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1167  acyl-CoA thioesterase  29.41 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.862365 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
161 aa  67.8  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 
136 aa  68.2  0.00000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 
148 aa  67  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  38.06 
 
 
154 aa  67  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  33.57 
 
 
149 aa  66.6  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  31.16 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  31.11 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 
161 aa  65.9  0.0000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  29.2 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  29.5 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  34.65 
 
 
135 aa  63.5  0.0000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
136 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
138 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  32.28 
 
 
134 aa  60.8  0.000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
157 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  29.29 
 
 
149 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
134 aa  59.3  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 
138 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  32.85 
 
 
136 aa  58.2  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2065  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0110405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  28.47 
 
 
288 aa  57.4  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>