More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1873 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 286 aa  577  1e-164  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  65.37 
 
 		 287 aa  379  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  61.84 
 
 		 289 aa  372  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  61.79 
 
 		 285 aa  369  1e-101  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  59.51 
 
 		 292 aa  344  1e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  58.21 
 
 		 289 aa  325  5e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  56.89 
 
 		 287 aa  320  9.999999999999999e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  56.84 
 
 		 288 aa  321  9.999999999999999e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  56.54 
 
 		 287 aa  319  3e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  55.71 
 
 		 287 aa  311  4.999999999999999e-84  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  54.89 
 
 		 138 aa  159  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  50.36 
 
 		 148 aa  149  5e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  48.25 
 
 		 154 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  49.65 
 
 		 154 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  49.65 
 
 		 145 aa  138  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  46.53 
 
 		 149 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  46.53 
 
 		 149 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  45.39 
 
 		 145 aa  130  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  47.22 
 
 		 149 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  54.61 
 
 		 147 aa  125  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164385  normal  0.0598732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1429  GCN5-related N-acetyltransferase  52.9 
 
 		 142 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.097269  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  55.17 
 
 		 148 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6182  GCN5-related N-acetyltransferase  55.17 
 
 		 148 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  55.17 
 
 		 148 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  47.26 
 
 		 148 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  52.17 
 
 		 141 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5197  GCN5-related N-acetyltransferase  53.79 
 
 		 146 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1193  acetyltransferase  50.34 
 
 		 146 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1429  acetyltransferase  50.34 
 
 		 146 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.993913  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2285  acetyltransferase  50.34 
 
 		 146 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0739487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2324  acetyltransferase  50.34 
 
 		 146 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3384  acetyltransferase  50.34 
 
 		 146 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.690506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1920  acetyltransferase  50.34 
 
 		 146 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2447  acetyltransferase  50.34 
 
 		 151 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.657539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0440  GCN5-related N-acetyltransferase  46.72 
 
 		 168 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293848  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  49.65 
 
 		 298 aa  110  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688065  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2150  acetyltransferase  49.66 
 
 		 213 aa  109  5e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  51.03 
 
 		 146 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  48.97 
 
 		 146 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  48.97 
 
 		 146 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 		 146 aa  105  7e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  44.93 
 
 		 141 aa  104  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  48.67 
 
 		 150 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  46.62 
 
 		 170 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  50.81 
 
 		 143 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  43.88 
 
 		 146 aa  101  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 143 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1473  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 		 150 aa  100  4e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211829  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  40.58 
 
 		 140 aa  99.8  5e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 143 aa  99.8  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1766  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  49.25 
 
 		 141 aa  97.4  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  40.71 
 
 		 142 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  41.43 
 
 		 156 aa  95.9  6e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.0000000131755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  42.75 
 
 		 140 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal  0.0182622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3362  acetyltransferase, GNAT family  43.48 
 
 		 143 aa  93.2  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000707749  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  42.86 
 
 		 141 aa  93.2  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4018  acetyltransferase  40.71 
 
 		 142 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565073  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1815  GCN5-related N-acetyltransferase  40.71 
 
 		 142 aa  92.4  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  40.43 
 
 		 141 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  41.3 
 
 		 144 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2576  putative acetyl transferase  42.03 
 
 		 141 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.71 
 
 		 141 aa  90.9  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  43.44 
 
 		 138 aa  90.5  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.13 
 
 		 145 aa  89.7  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  46.09 
 
 		 145 aa  89.7  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30090  putative acetyl transferase  41.3 
 
 		 141 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  39.37 
 
 		 155 aa  89.4  6e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06024  acetyltransferase  36.51 
 
 		 141 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 		 162 aa  88.6  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  49.59 
 
 		 145 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.441761  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.27 
 
 		 153 aa  88.6  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 135 aa  88.6  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  40 
 
 		 141 aa  87.4  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  37.9 
 
 		 141 aa  87.8  2e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2995  GCN5-related N-acetyltransferase  41.6 
 
 		 140 aa  87.8  2e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0110  GCN5-related N-acetyltransferase  46.72 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02374  putative Glr3403 protein  33.82 
 
 		 152 aa  85.5  9e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.652622  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2400  GCN5-related protein N-acetyltransferase  47.48 
 
 		 161 aa  84.7  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.861634  normal  0.498866 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  42.15 
 
 		 144 aa  84  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.268987  normal  0.639753 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 		 149 aa  84.3  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  36.8 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  37.8 
 
 		 139 aa  82  0.000000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  39.13 
 
 		 152 aa  81.6  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2938  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 		 177 aa  81.3  0.00000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.72 
 
 		 134 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  38.89 
 
 		 139 aa  80.5  0.00000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 		 159 aa  80.5  0.00000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.595635 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1624  acetyltransferase  39.02 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 		 147 aa  79.7  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.72 
 
 		 134 aa  79.3  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  34.29 
 
 		 138 aa  79.3  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00376684 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1295  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 164 aa  79  0.00000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2599  GCN5-related N-acetyltransferase  41.13 
 
 		 150 aa  79  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2986  acetyltransferase, GNAT family  41.13 
 
 		 145 aa  79  0.0000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0143175  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2823  acetyltransferase  37.3 
 
 		 144 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000798429  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>