262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0686 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
145 aa  296  6e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  41.61 
 
 
148 aa  101  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  39.29 
 
 
288 aa  96.7  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  41.73 
 
 
138 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.14 
 
 
285 aa  95.1  3e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  40.3 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  39.46 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
149 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  37.16 
 
 
292 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.58 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.56 
 
 
145 aa  92.4  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  36.23 
 
 
154 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.14 
 
 
141 aa  90.1  9e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  38.13 
 
 
286 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  35.71 
 
 
154 aa  87.4  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  36.36 
 
 
287 aa  85.9  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  37.14 
 
 
287 aa  85.1  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.32 
 
 
153 aa  83.6  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  36.43 
 
 
289 aa  84  7e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  36.43 
 
 
287 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.65 
 
 
289 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  33.57 
 
 
287 aa  71.6  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
140 aa  70.1  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 
141 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  36.23 
 
 
134 aa  65.5  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
139 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
152 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  33.86 
 
 
139 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
134 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.36 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.08 
 
 
149 aa  61.6  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.31 
 
 
148 aa  60.8  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
162 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  29.93 
 
 
152 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2583  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.19 
 
 
141 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412087  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3893  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.21 
 
 
161 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0321  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.11 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0804  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.11 
 
 
161 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.913321  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0698  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.05 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1979  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105854  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0773  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.71 
 
 
161 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.289929  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  34.33 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  34.81 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  34.81 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  34.81 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  34.81 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0681  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.05 
 
 
161 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  34.81 
 
 
164 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  34.81 
 
 
161 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  34.85 
 
 
134 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  32.87 
 
 
160 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.62 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.63 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 
145 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
136 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.77 
 
 
134 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.23 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.23 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.23 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.24 
 
 
159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  35.8 
 
 
130 aa  55.5  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.64 
 
 
139 aa  55.1  0.0000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  27.48 
 
 
149 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  27.48 
 
 
181 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  27.48 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  27.48 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  27.48 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  27.48 
 
 
181 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
145 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 
138 aa  54.3  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
133 aa  53.9  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.28 
 
 
151 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.55 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
145 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
136 aa  53.9  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.13 
 
 
151 aa  53.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 
137 aa  52.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  26.47 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  27.48 
 
 
203 aa  53.1  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2542  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.03 
 
 
133 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000475401  hitchhiker  0.00000263931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  32.53 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.62 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.59 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.02 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.59 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.47 
 
 
134 aa  52  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.93 
 
 
137 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.34 
 
 
137 aa  51.6  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>