More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2862 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 292 aa  596  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  65.36 
 
 		 285 aa  382  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  65.49 
 
 		 287 aa  370  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  62.72 
 
 		 289 aa  370  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  61.32 
 
 		 288 aa  351  5.9999999999999994e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  61.27 
 
 		 287 aa  350  2e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  60.92 
 
 		 287 aa  348  4e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  60.56 
 
 		 289 aa  338  8e-92  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  59.51 
 
 		 286 aa  331  7.000000000000001e-90  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  55.44 
 
 		 287 aa  321  9.000000000000001e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  53.38 
 
 		 138 aa  156  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  49.32 
 
 		 154 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.52 
 
 		 145 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  52.08 
 
 		 149 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  47.52 
 
 		 145 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  46.21 
 
 		 148 aa  140  3e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  48.94 
 
 		 154 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  47.22 
 
 		 149 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  47.22 
 
 		 149 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  48.03 
 
 		 148 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  52.48 
 
 		 145 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 		 141 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  48.25 
 
 		 148 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6182  GCN5-related N-acetyltransferase  48.25 
 
 		 148 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  48.25 
 
 		 148 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  49.29 
 
 		 143 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  48.94 
 
 		 143 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  48.23 
 
 		 143 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5197  GCN5-related N-acetyltransferase  48.95 
 
 		 146 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  49.63 
 
 		 147 aa  109  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164385  normal  0.0598732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  46.85 
 
 		 146 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1429  GCN5-related N-acetyltransferase  48.89 
 
 		 142 aa  106  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.097269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1330  GCN5-related N-acetyltransferase  44.27 
 
 		 146 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0879736  normal  0.150143 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  42.66 
 
 		 146 aa  104  1e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 		 141 aa  103  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.14 
 
 		 141 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  42.14 
 
 		 140 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2150  acetyltransferase  45.45 
 
 		 213 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1193  acetyltransferase  44.76 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1429  acetyltransferase  44.76 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.993913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2447  acetyltransferase  44.76 
 
 		 151 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.657539  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  44.76 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2285  acetyltransferase  44.76 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0739487  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2324  acetyltransferase  44.76 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  44.76 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1920  acetyltransferase  44.76 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3384  acetyltransferase  44.76 
 
 		 146 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.690506  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1843  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 		 159 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2113  GCN5-related N-acetyltransferase  42.31 
 
 		 147 aa  96.7  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1763  GCN5-related N-acetyltransferase  41.54 
 
 		 147 aa  95.9  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0440  GCN5-related N-acetyltransferase  40.44 
 
 		 168 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293848  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  45.39 
 
 		 150 aa  94  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1275  hypothetical protein  48.18 
 
 		 143 aa  92.8  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.16 
 
 		 145 aa  93.2  5e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1473  GCN5-related N-acetyltransferase  44.74 
 
 		 150 aa  92.8  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211829  normal  0.168372 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1624  acetyltransferase  39.19 
 
 		 161 aa  92.8  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1766  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 		 322 aa  92.4  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  47.62 
 
 		 138 aa  92  9e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2844  acetyltransferase, GNAT family  38.52 
 
 		 144 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0189947  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2603  acetyltransferase  39.26 
 
 		 144 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280255  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  42.28 
 
 		 149 aa  90.9  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2792  acetyltransferase  39.26 
 
 		 144 aa  90.9  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.7554  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  39.2 
 
 		 141 aa  90.5  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 		 298 aa  90.5  3e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688065  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 		 141 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.41 
 
 		 153 aa  90.1  4e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2799  acetyltransferase, GNAT family  39.26 
 
 		 144 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000134155 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  39.44 
 
 		 144 aa  89.7  5e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2823  acetyltransferase  38.52 
 
 		 144 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000798429  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  37.68 
 
 		 141 aa  89.7  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2522  acetyltransferase  38.52 
 
 		 144 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369491  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2555  acetyltransferase  38.52 
 
 		 144 aa  89  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0530574  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  40.29 
 
 		 142 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  36.69 
 
 		 146 aa  85.5  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  42.45 
 
 		 141 aa  85.1  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3362  acetyltransferase, GNAT family  38.57 
 
 		 143 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000707749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3245  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 142 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000380354  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2597  GCN5-related N-acetyltransferase  37.04 
 
 		 144 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00223569  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2938  GCN5-related N-acetyltransferase  37.24 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 		 145 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.441761  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  45.08 
 
 		 170 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  37.86 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  34.59 
 
 		 135 aa  82.8  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0217  aminotransferase class I and II  36.59 
 
 		 521 aa  82.8  0.000000000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  38.13 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal  0.0182622 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  34.11 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 		 144 aa  81.6  0.00000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.268987  normal  0.639753 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 		 144 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0110  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 		 296 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  36.51 
 
 		 144 aa  82  0.00000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.0000000131755 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2599  GCN5-related N-acetyltransferase  39.68 
 
 		 150 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2986  acetyltransferase, GNAT family  39.68 
 
 		 145 aa  81.3  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0143175  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4018  acetyltransferase  39.57 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565073  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1295  GCN5-related N-acetyltransferase  40.74 
 
 		 164 aa  80.5  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2576  putative acetyl transferase  39.57 
 
 		 141 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1815  GCN5-related N-acetyltransferase  39.57 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  39.86 
 
 		 144 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2802  acetyltransferase, GNAT family  35.82 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.283335  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>