More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1275 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1275  hypothetical protein  100 
 
 
143 aa  281  2.0000000000000002e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1383  acyltransferase-like protein  55.97 
 
 
170 aa  140  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0569267  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1833  GCN5-related N-acetyltransferase  52.14 
 
 
147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0164385  normal  0.0598732 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1429  GCN5-related N-acetyltransferase  53.62 
 
 
142 aa  131  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.097269  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3600  GCN5-related N-acetyltransferase  50.39 
 
 
141 aa  130  6e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.189095  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2404  GCN5-related N-acetyltransferase  48.2 
 
 
141 aa  129  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0613463 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0440  GCN5-related N-acetyltransferase  51.09 
 
 
168 aa  128  3e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.293848  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3623  GCN5-related N-acetyltransferase  49.61 
 
 
142 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.928868  normal  0.813134 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3362  acetyltransferase, GNAT family  45.65 
 
 
143 aa  127  7.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000707749  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  50.75 
 
 
156 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.0000000131755 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3194  GCN5-related N-acetyltransferase  46.32 
 
 
140 aa  123  9e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.717042  normal  0.0182622 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2448  GCN5-related N-acetyltransferase  47.33 
 
 
140 aa  123  1e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4018  acetyltransferase  46.46 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.565073  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1815  GCN5-related N-acetyltransferase  46.46 
 
 
142 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.135048  normal  0.188952 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3422  GCN5-related N-acetyltransferase  46.46 
 
 
144 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1673  acyltransferase-like  42.42 
 
 
320 aa  118  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28400  GCN5-related N-acetyltransferase  50.39 
 
 
141 aa  118  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2576  putative acetyl transferase  48.03 
 
 
141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06024  acetyltransferase  40.15 
 
 
141 aa  114  5e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  48.92 
 
 
287 aa  114  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30090  putative acetyl transferase  47.24 
 
 
141 aa  114  5e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2507  GCN5-related N-acetyltransferase  47.52 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.484168  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0544  GCN5-related N-acetyltransferase  46.09 
 
 
146 aa  110  8.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1915  putative acetyltransferase  39.02 
 
 
141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.493775  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1766  GCN5-related N-acetyltransferase  48.78 
 
 
322 aa  109  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.151465  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1774  hypothetical protein  52.46 
 
 
148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  48.18 
 
 
292 aa  108  4.0000000000000004e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  51.22 
 
 
298 aa  107  7.000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688065  normal  0.423362 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2599  GCN5-related N-acetyltransferase  41.04 
 
 
150 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0049  GCN5-related N-acetyltransferase  48.51 
 
 
138 aa  105  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2986  acetyltransferase, GNAT family  41.04 
 
 
145 aa  105  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0143175  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1664  GCN5-related N-acetyltransferase  48 
 
 
144 aa  104  3e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2150  acetyltransferase  44.44 
 
 
213 aa  103  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.340966  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5197  GCN5-related N-acetyltransferase  44.44 
 
 
146 aa  102  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2995  GCN5-related N-acetyltransferase  46.62 
 
 
140 aa  102  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.288317 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3270  GCN5-related N-acetyltransferase  39.71 
 
 
138 aa  102  1e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00376684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1920  GCN5-related N-acetyltransferase  45.19 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.391479 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6182  GCN5-related N-acetyltransferase  45.19 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1897  GCN5-related N-acetyltransferase  45.19 
 
 
148 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  47.06 
 
 
287 aa  101  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  39.73 
 
 
146 aa  101  4e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2447  acetyltransferase  43.06 
 
 
151 aa  100  5e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.657539  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2285  acetyltransferase  43.06 
 
 
146 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0739487  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1193  acetyltransferase  43.06 
 
 
146 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1429  acetyltransferase  43.06 
 
 
146 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.993913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3384  acetyltransferase  43.06 
 
 
146 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.690506  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1920  acetyltransferase  43.06 
 
 
146 aa  100  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2324  acetyltransferase  43.06 
 
 
146 aa  100  6e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.428752  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0771  GCN5-related N-acetyltransferase  44.54 
 
 
143 aa  100  8e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1113  GCN5-related N-acetyltransferase  37.3 
 
 
144 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00477349  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1136  GCN5-related N-acetyltransferase  37.3 
 
 
144 aa  100  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00122389  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  43.45 
 
 
146 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2788  GCN5-related N-acetyltransferase  45.52 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.349423  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1127  acetyltransferase  45.52 
 
 
138 aa  98.6  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0323  GCN5-related N-acetyltransferase  46.77 
 
 
138 aa  98.2  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.641899 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  49.3 
 
 
289 aa  98.2  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1834  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
146 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
287 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
287 aa  96.7  1e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0647  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
148 aa  95.5  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1806  GCN5-related N-acetyltransferase  46.67 
 
 
146 aa  95.9  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.107166  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3246  GCN5-related N-acetyltransferase  49.63 
 
 
141 aa  95.5  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.127143  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0280  GCN5-related N-acetyltransferase  44.35 
 
 
155 aa  95.9  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.539366  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2938  GCN5-related N-acetyltransferase  41.43 
 
 
177 aa  94.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1624  acetyltransferase  36.92 
 
 
161 aa  94.4  5e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0718  GCN5-related N-acetyltransferase  43.38 
 
 
149 aa  94  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0919  GCN5-related N-acetyltransferase  46.21 
 
 
145 aa  93.6  9e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.441761  normal  0.570602 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  38.97 
 
 
162 aa  92.8  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.158391  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  47.76 
 
 
286 aa  92.4  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4334  GCN5-related N-acetyltransferase  47.29 
 
 
143 aa  92.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4351  GCN5-related N-acetyltransferase  46.83 
 
 
145 aa  91.7  3e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.620863 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4202  GCN5-related N-acetyltransferase  46.51 
 
 
143 aa  91.3  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4357  GCN5-related N-acetyltransferase  47.29 
 
 
143 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.744506  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2386  GCN5-related N-acetyltransferase  45.6 
 
 
144 aa  89.4  1e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.268987  normal  0.639753 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2943  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
156 aa  89.7  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.91 
 
 
285 aa  89.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  44.6 
 
 
288 aa  89  2e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2603  acetyltransferase  35.43 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.280255  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2792  acetyltransferase  35.43 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.7554  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1134  GCN5-related N-acetyltransferase  39.01 
 
 
140 aa  88.2  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415058  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1282  acetyltransferase, GNAT family  40.14 
 
 
140 aa  88.6  3e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1069  acetyltransferase  39.37 
 
 
149 aa  88.2  3e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1432  GCN5-related N-acetyltransferase  48.78 
 
 
150 aa  87.8  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.114936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2844  acetyltransferase, GNAT family  34.65 
 
 
144 aa  88.2  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0189947  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2823  acetyltransferase  34.65 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000798429  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1190  GCN5-related N-acetyltransferase  41.26 
 
 
159 aa  87.4  5e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.595635 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2522  acetyltransferase  35.43 
 
 
144 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0369491  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4062  acetyltransferase, GNAT family  39.72 
 
 
140 aa  87.8  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.048127  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0688  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0716  GCN5-related N-acetyltransferase  36.17 
 
 
149 aa  87.8  5e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.795595  normal  0.113165 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2843  GCN5-related N-acetyltransferase  45.24 
 
 
139 aa  87  7e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1128  acetyltransferase  37.59 
 
 
140 aa  87  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0944  GCN5-related N-acetyltransferase  38.21 
 
 
123 aa  87  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1121  acetyltransferase  37.59 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1308  acetyltransferase, GNAT family  37.59 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000157971 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2597  GCN5-related N-acetyltransferase  34.65 
 
 
144 aa  86.3  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00223569  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1240  acetyltransferase  37.59 
 
 
140 aa  86.3  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.797535  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2429  hypothetical protein  51.28 
 
 
99 aa  86.3  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00460965  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2142  acetyltransferase  38.93 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000170191  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>