More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_2027 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
141 aa  284  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  42.45 
 
 
154 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 
145 aa  112  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  42.75 
 
 
154 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  42.55 
 
 
148 aa  110  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.29 
 
 
145 aa  108  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  41.13 
 
 
149 aa  106  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  40.14 
 
 
292 aa  103  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  40.6 
 
 
138 aa  99.8  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
288 aa  96.3  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.86 
 
 
153 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  40.43 
 
 
287 aa  94.7  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  37.86 
 
 
287 aa  93.2  1e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  38.19 
 
 
149 aa  92.8  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  39.72 
 
 
287 aa  92.8  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  35.71 
 
 
286 aa  91.3  4e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.97 
 
 
285 aa  90.9  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.14 
 
 
145 aa  90.1  9e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
289 aa  88.6  2e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.97 
 
 
289 aa  88.6  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  37.32 
 
 
135 aa  87.8  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  39.1 
 
 
141 aa  86.3  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  39.1 
 
 
152 aa  85.1  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.68 
 
 
148 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  35.71 
 
 
287 aa  80.5  0.000000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  36.57 
 
 
152 aa  79.3  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  39.1 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
139 aa  76.6  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  31.16 
 
 
139 aa  75.1  0.0000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
140 aa  70.9  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  34.85 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.91 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1979  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 
136 aa  65.1  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105854  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.91 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.88 
 
 
144 aa  64.3  0.0000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  29.51 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.86 
 
 
131 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.29 
 
 
137 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  34.88 
 
 
134 aa  63.2  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
136 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.06 
 
 
140 aa  62.8  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  39.6 
 
 
145 aa  62.4  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 
140 aa  62  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.53 
 
 
134 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
134 aa  61.6  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3039  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.03 
 
 
138 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  34.15 
 
 
144 aa  60.8  0.000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1945  thioesterase family protein  43.68 
 
 
164 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2077  hypothetical protein  43.68 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3252  putative thioesterase  43.68 
 
 
161 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  43.68 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  31.46 
 
 
146 aa  60.8  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3237  thioesterase family protein  43.68 
 
 
164 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2665  thioesterase family protein  43.68 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0831  thioesterase family protein  43.68 
 
 
161 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.18 
 
 
134 aa  60.5  0.000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  42.35 
 
 
134 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.23 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1603  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.68 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000704517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.18 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  39.76 
 
 
128 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  42.53 
 
 
160 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0277  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.59 
 
 
144 aa  58.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.3 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  36.3 
 
 
132 aa  58.5  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.61 
 
 
169 aa  58.9  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.09 
 
 
136 aa  58.2  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.34 
 
 
149 aa  58.5  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.04 
 
 
148 aa  58.2  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
129 aa  57.8  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.06 
 
 
135 aa  57.8  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.07 
 
 
136 aa  57.8  0.00000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2372  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.87 
 
 
133 aa  57.8  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000888459  normal  0.224754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  27.69 
 
 
136 aa  57.8  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  27.14 
 
 
162 aa  57.4  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
138 aa  56.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.77 
 
 
153 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 
149 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2444  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.06 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000193862  normal  0.240329 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1064  hypothetical protein  32.12 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2535  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.06 
 
 
133 aa  57  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000842763  normal  0.159999 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2752  hypothetical protein  32.54 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.81 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1781  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000346998  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1738  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000578703  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  29.46 
 
 
152 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2542  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000475401  hitchhiker  0.00000263931 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1742  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000282054  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2228  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.94 
 
 
140 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.159905  hitchhiker  0.000289051 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 
149 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0945  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.39 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 
143 aa  55.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.65 
 
 
159 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  31.54 
 
 
134 aa  55.1  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.93 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>