231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_2189 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  100 
 
 
148 aa  308  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  40.28 
 
 
152 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
152 aa  103  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  35.25 
 
 
141 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1990  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
287 aa  80.9  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.68 
 
 
141 aa  80.9  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1714  thioesterase superfamily protein  32.31 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.353313  normal  0.297354 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2829  GCN5-related N-acetyltransferase  31.2 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.136919 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  32.09 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
286 aa  74.3  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  36.29 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 
145 aa  73.2  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2862  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
292 aa  73.2  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  31.06 
 
 
148 aa  73.2  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.75 
 
 
145 aa  72.8  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 
139 aa  72.4  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
140 aa  71.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  29.27 
 
 
289 aa  72  0.000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 
138 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2411  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
135 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.55 
 
 
285 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0557  thioesterase superfamily protein  33.59 
 
 
129 aa  67.4  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.977538  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  29.92 
 
 
130 aa  67.4  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2993  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.4 
 
 
153 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.695823  normal  0.0154656 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 
149 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.13 
 
 
133 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.36 
 
 
133 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
149 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  26.28 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.5 
 
 
137 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  27.91 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.55 
 
 
131 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  29.2 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1979  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
136 aa  62  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.105854  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3385  GCN5-related N-acetyltransferase  33.06 
 
 
287 aa  62.8  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00858508  normal  0.169871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
128 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0686  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.31 
 
 
145 aa  60.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.850618  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  28.15 
 
 
287 aa  61.2  0.000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2382  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.71 
 
 
289 aa  60.5  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.715533  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
138 aa  60.5  0.000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2577  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 
192 aa  59.7  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  25.53 
 
 
145 aa  60.1  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.42 
 
 
134 aa  59.7  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.55 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3302  thioesterase superfamily protein  29.55 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.192522  normal  0.395393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2197  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
139 aa  58.2  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021618  normal  0.193812 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.83 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 
133 aa  57.4  0.00000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2118  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 
153 aa  56.2  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  28.45 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4902  thioesterase-like  27.61 
 
 
165 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  55.5  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25 
 
 
133 aa  55.5  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2179  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 
149 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  31.45 
 
 
154 aa  54.7  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.05 
 
 
145 aa  53.9  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  32.58 
 
 
135 aa  53.9  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2690  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 
137 aa  53.9  0.0000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.61 
 
 
134 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  24.43 
 
 
155 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.78 
 
 
136 aa  52.8  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.81 
 
 
149 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.43 
 
 
155 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52.8  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1273  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.65 
 
 
150 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.145521  normal  0.288665 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  52  0.000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  28.1 
 
 
160 aa  51.2  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  24.77 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.68 
 
 
150 aa  51.2  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.79 
 
 
140 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.37 
 
 
124 aa  50.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  24.19 
 
 
134 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  22.4 
 
 
143 aa  50.1  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.23 
 
 
146 aa  49.7  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  25.35 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  27.54 
 
 
141 aa  50.1  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1827  putative 4-hydroxybenzoyl-COA thioesterase protein  25 
 
 
148 aa  48.9  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.115256  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.81 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>