185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2118 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2118  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 153 aa  310  3.9999999999999997e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.55 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30 
 
 		 138 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  30.83 
 
 		 145 aa  64.3  0.0000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  28.46 
 
 		 133 aa  62  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.3 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1073  thioesterase  34.07 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.673051  normal  0.306888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70350  hypothetical protein  28.79 
 
 		 154 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3023  thioesterase superfamily protein  31.45 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.26011  normal  0.566778 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 152 aa  58.9  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  27.78 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.71 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2524  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 		 285 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0525704  hitchhiker  0.00982714 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  33.87 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  26.87 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1409  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.062257 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0608  thioesterase superfamily protein  28.83 
 
 		 135 aa  56.6  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2189  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.19 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2329  thioesterase superfamily protein  32.47 
 
 		 139 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.383331 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2098  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 136 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.206892 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2451  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.65 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  33.59 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2936  thioesterase superfamily protein  27.87 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.535343  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  31.11 
 
 		 136 aa  54.7  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  32.17 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  28.41 
 
 		 138 aa  55.1  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.16 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  23.81 
 
 		 141 aa  54.7  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4317  thioesterase superfamily protein  30.7 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.81 
 
 		 138 aa  53.9  0.0000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  27.2 
 
 		 138 aa  54.3  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  31.09 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  32.26 
 
 		 130 aa  53.5  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  28.74 
 
 		 146 aa  53.1  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  29.7 
 
 		 138 aa  53.5  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2679  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.79 
 
 		 134 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0763  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.6 
 
 		 159 aa  52.4  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.21776  normal  0.179555 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0791  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.88 
 
 		 134 aa  52  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 		 144 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4381  thioesterase superfamily protein  25.78 
 
 		 148 aa  52  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0970291 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2733  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.352685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  27.27 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2777  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.259185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1800  thioesterase-like protein  26.36 
 
 		 287 aa  51.2  0.000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.112186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2763  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 		 139 aa  51.2  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205921  normal  0.700299 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_92060  predicted protein  29.46 
 
 		 135 aa  50.8  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.691769  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  26.45 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2735  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 		 137 aa  50.8  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 152 aa  50.4  0.000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.52 
 
 		 159 aa  50.4  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.164673  normal  0.152655 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1533  hypothetical protein  23.58 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1450  hypothetical protein  23.58 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.09 
 
 		 150 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1873  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 286 aa  50.4  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.104835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1931  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  25.81 
 
 		 134 aa  49.3  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 		 137 aa  48.9  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.96 
 
 		 145 aa  48.5  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 		 149 aa  48.9  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1841  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.4 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00333557  normal  0.105066 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4734  thioesterase superfamily protein  31.62 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.33 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1474  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.291096  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.14 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.1 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.1 
 
 		 133 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1773  putative thioesterase protein  27.2 
 
 		 149 aa  47  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.927343 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.94 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.14 
 
 		 134 aa  47.4  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.14 
 
 		 134 aa  47  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  30.19 
 
 		 145 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.14 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.14 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.21 
 
 		 145 aa  47  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.95 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.95 
 
 		 138 aa  47  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  28.24 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1433  thioesterase superfamily protein  28 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.164009 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.6 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1575  thioesterase superfamily protein  42.65 
 
 		 162 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.242963 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3415  GCN5-related N-acetyltransferase  24.8 
 
 		 289 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.229891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0841  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3997  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.37 
 
 		 150 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.666415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.51 
 
 		 134 aa  45.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  28.89 
 
 		 152 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  32.14 
 
 		 140 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.01 
 
 		 143 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.23 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>