290 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1863 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  100 
 
 
147 aa  303  7e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  42.4 
 
 
145 aa  94  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  35.34 
 
 
143 aa  88.6  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  36.73 
 
 
149 aa  85.9  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  36.22 
 
 
142 aa  81.6  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  35.38 
 
 
141 aa  80.1  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
131 aa  79  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1601  esterase  34.88 
 
 
142 aa  79.3  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  31.88 
 
 
140 aa  73.9  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  29.85 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  29.46 
 
 
142 aa  73.9  0.0000000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  30.08 
 
 
149 aa  71.6  0.000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  33.33 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  35.09 
 
 
118 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
142 aa  67.8  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  26.12 
 
 
150 aa  67.4  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  25.36 
 
 
150 aa  66.2  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  33.33 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  25.78 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  25.78 
 
 
147 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  26.81 
 
 
146 aa  63.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  28.35 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 
132 aa  62.4  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 
143 aa  62  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  32.12 
 
 
180 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 
136 aa  61.2  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  28.8 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
147 aa  60.1  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2327  thioesterase superfamily protein  25.53 
 
 
162 aa  59.3  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0681506 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  23.19 
 
 
141 aa  59.3  0.00000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.52 
 
 
144 aa  57.8  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  27.42 
 
 
130 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  24.19 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
139 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  22.61 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 
143 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  25.76 
 
 
156 aa  57  0.00000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  24.58 
 
 
144 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  23.66 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.66 
 
 
148 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  24.8 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  30.09 
 
 
145 aa  56.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  30.16 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.66 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  24.22 
 
 
133 aa  55.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.66 
 
 
148 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.93 
 
 
115 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
137 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  26.61 
 
 
130 aa  55.1  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1972  thioesterase superfamily protein  27.86 
 
 
162 aa  55.1  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.618435 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  24 
 
 
134 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6106  hypothetical protein  28.97 
 
 
154 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  24.27 
 
 
142 aa  53.9  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
147 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.66 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.75 
 
 
145 aa  53.5  0.0000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 
143 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  23.48 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
146 aa  53.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  29.41 
 
 
151 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.9 
 
 
148 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  25.69 
 
 
147 aa  52.8  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
150 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.9 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  30.51 
 
 
149 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  29.73 
 
 
144 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  23.14 
 
 
147 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  31.93 
 
 
131 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.9 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.9 
 
 
148 aa  52.4  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
150 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
142 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  24.22 
 
 
147 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  22.61 
 
 
154 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3970  thioesterase superfamily protein  22.3 
 
 
155 aa  52  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  24.55 
 
 
149 aa  51.6  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  30.47 
 
 
153 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  26.12 
 
 
163 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.12 
 
 
136 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
150 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2800  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
138 aa  51.6  0.000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.562988 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
147 aa  51.2  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  24.3 
 
 
129 aa  51.6  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 
134 aa  51.2  0.000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  23.13 
 
 
141 aa  51.6  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1149  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1179  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 
163 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  21.74 
 
 
154 aa  50.8  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  21.74 
 
 
154 aa  51.2  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
134 aa  50.8  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
151 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
138 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  26.61 
 
 
150 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>