53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2100 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2100  thioesterase-like protein  100 
 
 		 147 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118365  normal  0.0327511 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5117  hypothetical protein  76.87 
 
 		 161 aa  239  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.357034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2091  hypothetical protein  76.19 
 
 		 147 aa  233  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2885  hypothetical protein  72.79 
 
 		 147 aa  224  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45600  hypothetical protein  68.46 
 
 		 131 aa  192  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3800  hypothetical protein  59.57 
 
 		 141 aa  182  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1456  esterase  48.57 
 
 		 141 aa  135  2e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.711822  normal  0.158502 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1354  esterase  39.58 
 
 		 143 aa  117  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0454  hypothetical protein  41.43 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1883  hypothetical protein  39.57 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.488202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3257  esterase  40.43 
 
 		 142 aa  114  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.599162  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1601  esterase  39.86 
 
 		 142 aa  110  5e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1413  thioesterase superfamily protein  40.44 
 
 		 145 aa  105  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364047  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0338  hypothetical protein  36.3 
 
 		 147 aa  102  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.124802  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0349  hypothetical protein  36.3 
 
 		 147 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2228  hypothetical protein  36.3 
 
 		 151 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00481735  hitchhiker  0.000000503639 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3335  esterase  40.52 
 
 		 118 aa  93.6  8e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  33.33 
 
 		 147 aa  70.5  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2881  putative thioesterase  41.1 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.510611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  23.36 
 
 		 139 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  25.83 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  23.44 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  22.22 
 
 		 132 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  22.13 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  23.66 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  21.6 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  21.97 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  23.14 
 
 		 147 aa  44.7  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  22.5 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  22.5 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  22.5 
 
 		 143 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  24.81 
 
 		 132 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  20.57 
 
 		 140 aa  43.5  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 137 aa  43.5  0.0009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  21.67 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  23.33 
 
 		 135 aa  43.1  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  21.67 
 
 		 146 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 		 131 aa  43.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  29.27 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  27.73 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0080  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4272  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0063  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  21.55 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  24.29 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  21.54 
 
 		 133 aa  40  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12499  hypothetical protein  30.99 
 
 		 138 aa  40.4  0.009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.113842 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 		 132 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 		 132 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 		 132 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  23.88 
 
 		 132 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>