218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1054 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 132 aa  274  3e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  92.42 
 
 		 132 aa  251  3e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  72.22 
 
 		 137 aa  198  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 132 aa  183  6e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 132 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 132 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 132 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 132 aa  183  7e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  67.69 
 
 		 135 aa  183  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 		 135 aa  183  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  69.23 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  69.23 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  69.23 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  69.23 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  69.23 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  66.92 
 
 		 135 aa  181  4.0000000000000006e-45  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  69.23 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  69.23 
 
 		 132 aa  180  5.0000000000000004e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  69.29 
 
 		 132 aa  179  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  36.51 
 
 		 137 aa  98.2  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  32.41 
 
 		 136 aa  66.6  0.00000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  35.34 
 
 		 135 aa  64.7  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.47 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  31.82 
 
 		 130 aa  62.8  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  35.04 
 
 		 134 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  35.45 
 
 		 135 aa  61.6  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 136 aa  60.1  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  26.77 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.58 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  30.48 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 136 aa  57.8  0.00000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.48 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 138 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.81 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  31.48 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 152 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  30.58 
 
 		 132 aa  54.7  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 133 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  26.77 
 
 		 149 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.31 
 
 		 133 aa  53.1  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 283 aa  53.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.94 
 
 		 135 aa  52.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 		 138 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.86 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  29.91 
 
 		 140 aa  51.2  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.31 
 
 		 155 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1458  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.19 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0173247  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  27.03 
 
 		 145 aa  50.4  0.000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  26.77 
 
 		 171 aa  50.4  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  27.03 
 
 		 167 aa  50.8  0.000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.95 
 
 		 150 aa  50.4  0.000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  30.3 
 
 		 155 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.09 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.2 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0724  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.763036  normal  0.174534 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  25.74 
 
 		 180 aa  50.1  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0680  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.10976  normal  0.819099 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.36 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1442  thioesterase superfamily protein  29.09 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.444446  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  29.37 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3114  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.144854  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  30.86 
 
 		 172 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.68 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 125 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 		 155 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.210746 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  32.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  32.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.69 
 
 		 134 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  31.37 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  27.27 
 
 		 143 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  26.85 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 		 128 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.37 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0731  putative thioesterase protein  28.18 
 
 		 134 aa  47.4  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.942813 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  26.4 
 
 		 143 aa  47.4  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.64 
 
 		 150 aa  47.8  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4678  thioesterase superfamily protein  27.03 
 
 		 136 aa  47.4  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.295608  normal  0.88684 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  26.85 
 
 		 130 aa  47.4  0.00007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  26.52 
 
 		 150 aa  47.4  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  23.73 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2953  putative thioesterase protein  27.87 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0150824  normal  0.668245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3476  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 141 aa  47  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.674685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  28.83 
 
 		 132 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  31.96 
 
 		 128 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.287125 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>