More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0003 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0003  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
125 aa  262  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00198303  unclonable  0.00000000031845 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0066  thioesterase superfamily protein  88 
 
 
128 aa  233  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4044  thioesterase superfamily protein  46.4 
 
 
132 aa  111  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.916534 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.7 
 
 
133 aa  94  6e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.7 
 
 
133 aa  94  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  40.77 
 
 
131 aa  90.9  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
166 aa  87.4  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.83 
 
 
137 aa  86.3  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0682  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  40.74 
 
 
134 aa  85.9  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.382877  normal  0.103995 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3072  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.29 
 
 
169 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.314971  normal  0.495384 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0787  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  42.2 
 
 
148 aa  84.7  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.267485  normal  0.324696 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1924  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  42.86 
 
 
191 aa  84.3  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1483  thioesterase superfamily protein  36.75 
 
 
133 aa  84  7e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.37599 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2343  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.84 
 
 
136 aa  83.6  8e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.49687  normal  0.168898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2157  thioesterase family protein  37.29 
 
 
133 aa  82.8  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.938479  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1849  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.62 
 
 
131 aa  82.8  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124156  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  33.88 
 
 
128 aa  81.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3205  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.71 
 
 
151 aa  81.3  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.473316  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2384  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.64 
 
 
204 aa  81.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.29549  normal  0.378744 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.19 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36 
 
 
129 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4268  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.61 
 
 
163 aa  78.6  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3175  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.4 
 
 
154 aa  79.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3500  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
151 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.076356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4799  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.38 
 
 
148 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.974363  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.6 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2632  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.25 
 
 
147 aa  77.8  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0064  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.53 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.246744  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0924  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.89 
 
 
144 aa  76.6  0.00000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0795864 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0063  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.53 
 
 
140 aa  76.6  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.57846  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3509  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
146 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3189  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1178  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.74 
 
 
128 aa  76.6  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3333  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
143 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  36.44 
 
 
130 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6904  thioesterase superfamily protein  35.96 
 
 
149 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0171127  normal  0.306193 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  36 
 
 
132 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1293  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.82 
 
 
154 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2137  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
147 aa  75.9  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0557  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase family protein  40.78 
 
 
126 aa  75.5  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3195  thioesterase superfamily protein  35.83 
 
 
143 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.3 
 
 
155 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.187008  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.18 
 
 
150 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3616  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
149 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.47995  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2799  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
141 aa  74.3  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3520  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.98 
 
 
153 aa  74.7  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.22411  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1727  hypothetical protein  35.25 
 
 
144 aa  74.3  0.0000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1007  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.6 
 
 
140 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4165  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.98 
 
 
153 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.161353  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0472  thioesterase superfamily protein  38.1 
 
 
131 aa  74.3  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.563842  normal  0.634378 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3976  hypothetical protein  36.51 
 
 
155 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0121514  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.28 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0729  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  39.82 
 
 
132 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.39084  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1025  thioesterase superfamily protein  36.59 
 
 
143 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1523  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  38.89 
 
 
132 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.010103  normal  0.859767 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5232  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.05 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.200026  normal  0.202993 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1256  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.17 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  36.07 
 
 
146 aa  73.2  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1067  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1139  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1106  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  41.59 
 
 
135 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.157487 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1071  thioesterase superfamily protein  34.17 
 
 
137 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2780  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
146 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5307  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.17 
 
 
143 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.145182  normal  0.895228 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2723  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  41.98 
 
 
153 aa  72.4  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  36.8 
 
 
154 aa  72.8  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1051  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
143 aa  72  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4765  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.17 
 
 
153 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3339  thioesterase superfamily protein  37.04 
 
 
148 aa  72  0.000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2090  hypothetical protein  37.93 
 
 
133 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000228869  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  34.35 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3123  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.85 
 
 
143 aa  71.6  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  37.84 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0786  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.04 
 
 
150 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0411186  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  38.89 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2233  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  35.45 
 
 
149 aa  70.5  0.000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3008  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
158 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2940  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.48 
 
 
145 aa  70.1  0.000000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2210  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.5 
 
 
133 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00606387 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  35.85 
 
 
126 aa  68.9  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0141  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37.04 
 
 
135 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  39.42 
 
 
139 aa  68.6  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  38.68 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1064  hypothetical protein  37.96 
 
 
141 aa  68.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4200  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.71 
 
 
150 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.367475  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0945  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  37.96 
 
 
141 aa  68.2  0.00000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1218  hypothetical protein  34.71 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.339856  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3199  thioesterase family protein  35.34 
 
 
164 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1247  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  34.71 
 
 
150 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.305337  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32 
 
 
136 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  36.61 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  35.29 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  34.45 
 
 
133 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  34.45 
 
 
133 aa  67  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  35.29 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35.29 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35.29 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  35.29 
 
 
134 aa  67  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>