244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2782 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2782  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
155 aa  315  2e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3071  thioesterase superfamily protein  45.26 
 
 
159 aa  131  3e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0835816  decreased coverage  0.0000000247003 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1355  thioesterase superfamily protein  38.51 
 
 
164 aa  102  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.024577  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0934  thioesterase superfamily protein  36.24 
 
 
181 aa  98.6  3e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2639  thioesterase superfamily protein  34.76 
 
 
166 aa  95.1  3e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0958965  normal  0.564769 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2301  thioesterase superfamily protein  40 
 
 
149 aa  94.7  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24680  predicted thioesterase  32.77 
 
 
182 aa  91.3  5e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.489708  normal  0.117336 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11530  predicted thioesterase  32.48 
 
 
173 aa  84.7  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4181  hypothetical protein  36.92 
 
 
141 aa  84  7e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
149 aa  82.8  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 
132 aa  81.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7358  thioesterase superfamily protein  35.43 
 
 
167 aa  81.6  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.249412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04420  predicted thioesterase  39.58 
 
 
148 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17668  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1095  thioesterase superfamily protein  30.67 
 
 
160 aa  77.4  0.00000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1523  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
134 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.64895  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08950  predicted thioesterase  33.12 
 
 
183 aa  75.5  0.0000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.936041  normal  0.0657601 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
283 aa  75.5  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3541  thioesterase superfamily protein  36.15 
 
 
148 aa  73.9  0.0000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.564899  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1613  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
129 aa  73.2  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357134  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3916  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
148 aa  70.9  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.539762 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2611  thioesterase family protein  32.84 
 
 
147 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
143 aa  70.5  0.000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1441  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
132 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  32.8 
 
 
135 aa  69.7  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  35.59 
 
 
146 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  30.95 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1330  thioesterase superfamily protein  35 
 
 
143 aa  69.3  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.262447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2551  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 
145 aa  69.7  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  34.65 
 
 
134 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1926  thioesterase superfamily protein  30.71 
 
 
136 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.187016 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27910  hypothetical protein  29.84 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0973  hypothetical protein  31.16 
 
 
138 aa  67.4  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0326933 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 
139 aa  66.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2356  hypothetical protein  29.37 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1590  thioesterase superfamily protein  28.35 
 
 
135 aa  66.6  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.359349  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  31.5 
 
 
142 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  35.04 
 
 
139 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2763  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.166608  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1132  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
149 aa  65.1  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0101  thioesterase superfamily protein  30.33 
 
 
161 aa  64.3  0.0000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  31.15 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2213  hypothetical protein  32.26 
 
 
144 aa  63.5  0.0000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0514913  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22190  Thioesterase superfamily  33.59 
 
 
151 aa  63.5  0.0000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3424  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 
147 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996991  normal  0.892609 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  36.72 
 
 
130 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4642  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  29.92 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4262  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0612  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 
148 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4643  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.92 
 
 
148 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1657  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
139 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11790  predicted thioesterase  29.03 
 
 
146 aa  61.6  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.347124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4343  thioesterase superfamily protein  30.89 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1693  thioesterase family protein  32.84 
 
 
159 aa  60.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1114  thioesterase family protein  33.09 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0224064  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0944  thioesterase family protein  33.09 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1871  thioesterase family protein  33.09 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0652374  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1556  thioesterase family protein  33.09 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000380649  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1717  thioesterase family protein  33.09 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0217  thioesterase family protein  33.09 
 
 
143 aa  60.8  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748592  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4623  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.35 
 
 
148 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.69926  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 
133 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1786  thioesterase superfamily protein  37.37 
 
 
213 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4411  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4250  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4627  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4751  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.13 
 
 
148 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  27.61 
 
 
136 aa  58.5  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  37.27 
 
 
137 aa  58.2  0.00000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0300  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 
145 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.535288  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  32.39 
 
 
153 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3214  thioesterase superfamily protein  23.29 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  29.63 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
145 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4185  thioesterase superfamily protein  27.74 
 
 
134 aa  56.2  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
145 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  32.33 
 
 
145 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 
143 aa  54.7  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4859  thioesterase superfamily protein  26.12 
 
 
134 aa  54.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
153 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  26.15 
 
 
139 aa  53.9  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  29.56 
 
 
203 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
148 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0859  hypothetical protein  28.79 
 
 
133 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  29.77 
 
 
163 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.54 
 
 
149 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  32.03 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  24.65 
 
 
140 aa  53.5  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  32.03 
 
 
149 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  34.94 
 
 
139 aa  53.5  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  32.03 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  32.03 
 
 
149 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>