114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2088 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
172 aa  341  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  67.84 
 
 
175 aa  228  4e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  63.95 
 
 
183 aa  215  2.9999999999999998e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  65.9 
 
 
176 aa  208  3e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  52.91 
 
 
200 aa  171  5.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  42.18 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  36.62 
 
 
181 aa  98.2  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  34.46 
 
 
181 aa  95.5  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  40.43 
 
 
175 aa  92.4  2e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  33.77 
 
 
193 aa  87.8  6e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  31.61 
 
 
178 aa  86.7  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  36.14 
 
 
190 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  30.41 
 
 
176 aa  84.3  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  40 
 
 
175 aa  84  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  30.38 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  31.76 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  31.76 
 
 
176 aa  83.2  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  31.76 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  35.26 
 
 
192 aa  82.4  0.000000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  31.85 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  31.76 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  35.54 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  31.97 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  31.97 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  30.61 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  37.69 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  31.29 
 
 
190 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  31.29 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  31.29 
 
 
176 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  31.51 
 
 
197 aa  79  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  31.08 
 
 
159 aa  78.6  0.00000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  28.77 
 
 
176 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  36.15 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  29.73 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  30.28 
 
 
180 aa  69.7  0.00000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  32 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  31.25 
 
 
180 aa  65.5  0.0000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  30.32 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
172 aa  62.4  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  34.29 
 
 
181 aa  62.4  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  36.36 
 
 
132 aa  59.3  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  26.21 
 
 
184 aa  57.8  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  26.6 
 
 
150 aa  52.4  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  26.67 
 
 
149 aa  51.6  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  31.07 
 
 
132 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
132 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  31.07 
 
 
132 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  31.07 
 
 
132 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 
132 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  31.07 
 
 
132 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  31.07 
 
 
132 aa  51.6  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  31.07 
 
 
132 aa  51.6  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  31.07 
 
 
132 aa  51.2  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  26.6 
 
 
150 aa  50.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  23.61 
 
 
187 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 
154 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 
154 aa  49.3  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4456  thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 
144 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
132 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
132 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
132 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 
132 aa  49.3  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
152 aa  48.9  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  30.86 
 
 
132 aa  48.5  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  26.17 
 
 
181 aa  47.4  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  29.9 
 
 
215 aa  47.8  0.00009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  22.56 
 
 
142 aa  47.4  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  31.75 
 
 
135 aa  47.4  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  21.54 
 
 
142 aa  47  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  28.77 
 
 
141 aa  46.2  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  29.11 
 
 
132 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
146 aa  46.6  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
150 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  26.25 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
150 aa  46.2  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  26.25 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  26.25 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 
142 aa  46.6  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  26.04 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  31.82 
 
 
143 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  22.14 
 
 
154 aa  45.4  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4183  thioesterase superfamily protein  27.4 
 
 
142 aa  45.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  24.32 
 
 
140 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  28.45 
 
 
139 aa  44.7  0.0007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 
136 aa  44.3  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  26.53 
 
 
147 aa  43.9  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1329  thioesterase superfamily protein  33.7 
 
 
157 aa  44.3  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2261  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
161 aa  43.9  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  28.21 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 
180 aa  43.1  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  23.33 
 
 
137 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  29.36 
 
 
138 aa  42.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  31.19 
 
 
145 aa  43.1  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  38.18 
 
 
133 aa  42.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0073  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  21.64 
 
 
144 aa  42.4  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 
134 aa  42  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1293  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  28.33 
 
 
154 aa  42  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>