50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2855 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  46.82 
 
 
176 aa  166  1e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  46.82 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  46.82 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  47.4 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  47.4 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  47.4 
 
 
176 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  46.82 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  46.82 
 
 
176 aa  165  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  46.82 
 
 
176 aa  164  5e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  45.66 
 
 
197 aa  163  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  47.46 
 
 
178 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  43.5 
 
 
190 aa  158  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  45.09 
 
 
176 aa  157  6e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  42.53 
 
 
176 aa  153  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  42.77 
 
 
176 aa  151  4e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  45.81 
 
 
176 aa  149  2e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  39.29 
 
 
175 aa  117  6e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 
190 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  34.25 
 
 
170 aa  94  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  31.21 
 
 
159 aa  90.1  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  34.75 
 
 
172 aa  88.6  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  31.61 
 
 
172 aa  86.7  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  40 
 
 
181 aa  85.5  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  35.51 
 
 
193 aa  82.4  0.000000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  31.52 
 
 
183 aa  81.6  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  32.33 
 
 
175 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  29.25 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  28.66 
 
 
176 aa  77  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  30.82 
 
 
175 aa  76.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  31.88 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  31.3 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  29.32 
 
 
192 aa  72  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  28.79 
 
 
176 aa  72.4  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  32.77 
 
 
181 aa  68.6  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  28.1 
 
 
175 aa  67.8  0.00000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
176 aa  65.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  30.37 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  25.47 
 
 
173 aa  62  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  27.34 
 
 
180 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0640  hypothetical protein  27.74 
 
 
185 aa  61.2  0.000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713767  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  27.01 
 
 
187 aa  60.5  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  25.76 
 
 
178 aa  59.3  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  27.46 
 
 
184 aa  57.8  0.00000009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  25.77 
 
 
180 aa  57.4  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10158  conserved hypothetical protein  24.32 
 
 
343 aa  56.2  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34859  predicted protein  28.06 
 
 
236 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0662849 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07874  conserved hypothetical protein  26.67 
 
 
306 aa  50.4  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310859  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02360  expressed protein  27.16 
 
 
371 aa  43.5  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.880113  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  23.78 
 
 
149 aa  41.6  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>