51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2112 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  348  2e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  47.06 
 
 
170 aa  137  6e-32  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  41.06 
 
 
159 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  39.29 
 
 
178 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  36.31 
 
 
176 aa  125  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  36.9 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  36.31 
 
 
176 aa  123  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  36.31 
 
 
197 aa  123  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  39.87 
 
 
190 aa  121  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  41.21 
 
 
192 aa  121  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  34.52 
 
 
176 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  35.12 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  35.12 
 
 
176 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  40.46 
 
 
172 aa  119  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  35.12 
 
 
176 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  35.12 
 
 
176 aa  118  3e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  35.12 
 
 
176 aa  119  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  35.12 
 
 
176 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  34.52 
 
 
176 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  34.52 
 
 
176 aa  117  9e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  36.9 
 
 
178 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  32.74 
 
 
176 aa  114  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  34.23 
 
 
176 aa  112  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  42.95 
 
 
183 aa  111  5e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  37.06 
 
 
190 aa  110  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  37.87 
 
 
176 aa  110  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  39.6 
 
 
181 aa  107  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  51.3 
 
 
181 aa  106  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  38.22 
 
 
175 aa  106  2e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  40.24 
 
 
175 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  38.82 
 
 
181 aa  104  8e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  41.04 
 
 
175 aa  101  5e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  38.61 
 
 
172 aa  99.8  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  42.54 
 
 
176 aa  99.8  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  35.1 
 
 
200 aa  91.3  6e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  37.5 
 
 
178 aa  89  3e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  28.66 
 
 
173 aa  87  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  32.54 
 
 
193 aa  87  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  31.21 
 
 
180 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  31.03 
 
 
180 aa  85.5  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  33.52 
 
 
181 aa  84.3  8e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  35.1 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34859  predicted protein  27.13 
 
 
236 aa  60.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0662849 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07874  conserved hypothetical protein  30.09 
 
 
306 aa  52.8  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.310859  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  25.55 
 
 
215 aa  48.9  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  21.68 
 
 
187 aa  48.5  0.00005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10158  conserved hypothetical protein  22.44 
 
 
343 aa  47.8  0.00007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  23.58 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  23.71 
 
 
136 aa  47  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0640  hypothetical protein  22.5 
 
 
185 aa  44.7  0.0007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00713767  normal 
 
 
-
 
NC_006691  CNF02360  expressed protein  22.83 
 
 
371 aa  40.8  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.880113  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>