120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15570 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  100 
 
 
175 aa  353  5e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1459  thioesterase superfamily protein  67.82 
 
 
200 aa  243  9.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.794665  normal  0.592247 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  64.77 
 
 
183 aa  236  9e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  67.84 
 
 
172 aa  228  4e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  61.36 
 
 
176 aa  197  5e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2747  thioesterase superfamily protein  39.04 
 
 
190 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.47725  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3069  hypothetical protein  38.1 
 
 
181 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.422351  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2773  thioesterase superfamily protein  37.66 
 
 
181 aa  106  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000495096 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2112  hypothetical protein  40.14 
 
 
175 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.461535 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0029  hypothetical protein  37.5 
 
 
175 aa  99  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.786921  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19420  predicted thioesterase  33.11 
 
 
193 aa  94  1e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.605254  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1361  hypothetical protein  36.31 
 
 
176 aa  93.2  2e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2661  hypothetical protein  35.76 
 
 
192 aa  92  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2447  hypothetical protein  35.62 
 
 
159 aa  91.7  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1307  thioesterase superfamily protein  34.16 
 
 
170 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0109632  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4064  hypothetical protein  30.87 
 
 
190 aa  87  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.470038  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3600  hypothetical protein  32.17 
 
 
176 aa  85.9  3e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0019  hypothetical protein  36.3 
 
 
175 aa  85.5  4e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.273731  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3867  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0126  hypothetical protein  31.43 
 
 
176 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3841  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3934  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4050  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  81.6  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0342  hypothetical protein  33.33 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0125  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4255  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4391  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4216  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  81.3  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4698  hypothetical protein  29.24 
 
 
176 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3547  hypothetical protein  32.52 
 
 
197 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0088  hypothetical protein  30.91 
 
 
176 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2657  hypothetical protein  31.55 
 
 
190 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.200121  normal  0.579719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0147  hypothetical protein  33.58 
 
 
176 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.621737  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2568  hypothetical protein  27.98 
 
 
173 aa  79  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0026  hypothetical protein  31.47 
 
 
178 aa  78.6  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00253798  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3336  hypothetical protein  32.1 
 
 
178 aa  72  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2855  hypothetical protein  28.1 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1753  thioesterase superfamily protein  28.05 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0481119 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  36.04 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0558  hypothetical protein  24.55 
 
 
184 aa  64.3  0.0000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231595  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0546  hypothetical protein  23.81 
 
 
187 aa  61.6  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.287146 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  33.33 
 
 
132 aa  59.7  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0028  hypothetical protein  28.57 
 
 
180 aa  58.5  0.00000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0709725  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  26.45 
 
 
136 aa  57.4  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  32.04 
 
 
155 aa  54.7  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  30.67 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  31.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  31.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  31.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  31.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  31.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  31.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  31.37 
 
 
132 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  31.37 
 
 
132 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  30.39 
 
 
132 aa  52.4  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0033  hypothetical protein  30.93 
 
 
180 aa  52  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.156531  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
137 aa  52  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  29.85 
 
 
135 aa  51.2  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  28.3 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  32.46 
 
 
138 aa  48.5  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3160  thioesterase superfamily protein  31.53 
 
 
180 aa  47.8  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0084  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  28.23 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  28.09 
 
 
137 aa  47.4  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0081  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 
154 aa  46.6  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 
136 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_34859  predicted protein  23.53 
 
 
236 aa  45.8  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0662849 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4269  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  32.84 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0066  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
146 aa  45.8  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0080  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0086  thioesterase superfamily protein  26.28 
 
 
150 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  31.17 
 
 
139 aa  45.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0083  thioesterase superfamily protein  25.9 
 
 
142 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 
143 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0074  thioesterase superfamily protein  27.05 
 
 
141 aa  45.4  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0095  thioesterase superfamily protein  37.84 
 
 
136 aa  45.4  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  26.62 
 
 
149 aa  45.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1329  thioesterase superfamily protein  29.2 
 
 
157 aa  45.1  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.78089  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0080  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  25.55 
 
 
142 aa  44.7  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2476  thioesterase-like protein  21.9 
 
 
141 aa  44.3  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.420578  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  25 
 
 
146 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0085  thioesterase superfamily protein  25.93 
 
 
154 aa  43.9  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  29.21 
 
 
132 aa  43.9  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  28.26 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  28.26 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  28.26 
 
 
135 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  32.58 
 
 
138 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  26.61 
 
 
150 aa  43.9  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  29.84 
 
 
140 aa  43.5  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  27.55 
 
 
139 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
163 aa  42.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1854  hypothetical protein  26.12 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5927  hypothetical protein  30.1 
 
 
147 aa  43.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.266343  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  31.31 
 
 
147 aa  43.5  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>