33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1854 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1854  hypothetical protein  100 
 
 
175 aa  365  1e-100  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3010  thioesterase-like protein  65.62 
 
 
175 aa  234  4e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  26.5 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  25.37 
 
 
132 aa  48.5  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  34 
 
 
150 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  30.21 
 
 
137 aa  45.1  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  25.86 
 
 
140 aa  45.1  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 
283 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
132 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
132 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
132 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
132 aa  44.7  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17120  predicted thioesterase  22.06 
 
 
183 aa  44.7  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0664935  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001138  predicted thioesterase  33 
 
 
150 aa  44.3  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  24.06 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  24.06 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  24.06 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  24.06 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  24.06 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  24.06 
 
 
132 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  23.31 
 
 
132 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  29.17 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  29.17 
 
 
135 aa  43.1  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  26.12 
 
 
175 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7357  thioesterase superfamily protein  36.49 
 
 
137 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  30.56 
 
 
143 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1527  hypothetical protein  26.12 
 
 
149 aa  42.7  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  23.31 
 
 
132 aa  42.4  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.5 
 
 
143 aa  42  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  23.62 
 
 
136 aa  40.8  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>