205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0486 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  100 
 
 		 132 aa  273  7e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  99.24 
 
 		 132 aa  271  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  94.7 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  94.7 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  94.7 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  94.7 
 
 		 132 aa  262  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  93.94 
 
 		 132 aa  261  3e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  89.31 
 
 		 132 aa  251  3e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  74.02 
 
 		 137 aa  199  9.999999999999999e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  69.47 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  69.47 
 
 		 135 aa  195  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  69.47 
 
 		 135 aa  193  7e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  69.23 
 
 		 132 aa  181  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  67.69 
 
 		 132 aa  179  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  39.37 
 
 		 137 aa  108  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  39.25 
 
 		 135 aa  67  0.00000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 136 aa  64.3  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2943  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.81 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000565224  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  33.63 
 
 		 134 aa  61.2  0.000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  30.77 
 
 		 145 aa  60.5  0.000000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  30.77 
 
 		 167 aa  60.5  0.000000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1359  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 134 aa  60.1  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.195734  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0258  thioesterase  29.46 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.024858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.74 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  31.63 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.74 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1275  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.09 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000950764  hitchhiker  0.000140311 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  29.1 
 
 		 140 aa  57  0.00000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  29.69 
 
 		 134 aa  57  0.00000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.6 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1245  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0111113  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.04 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  26.56 
 
 		 136 aa  55.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0658  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000013537  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1234  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.128192 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  32.04 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  30.97 
 
 		 134 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1373  thioesterase superfamily protein  28.78 
 
 		 283 aa  55.1  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.908063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3648  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 		 133 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.233147  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1852  thioesterase  24 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.304931  normal  0.230458 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3638  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.69 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3755  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.85 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2369  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.6 
 
 		 128 aa  54.7  0.0000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.154271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1820  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 150 aa  54.3  0.0000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000263065  decreased coverage  0.00285392 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 132 aa  54.3  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2903  thioesterase superfamily protein  28.7 
 
 		 166 aa  54.3  0.0000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0130041  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2718  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.77 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.401419  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3461  thioesterase family protein  30.11 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  31.37 
 
 		 175 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0562  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.31 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.409991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0780  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.2 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000472439  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0902  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.2 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000167631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0840  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.2 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal  0.646292 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0807  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.2 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000852325  normal  0.479233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0871  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  29.2 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0203461  normal  0.184267 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01168  thioesterase superfamily  33.03 
 
 		 140 aa  53.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.878559  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0749  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.23 
 
 		 150 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0148  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  38.46 
 
 		 146 aa  52.4  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0532  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.52 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.629499  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2812  thioesterase superfamily protein  33.82 
 
 		 152 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2088  thioesterase superfamily protein  31.07 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0701074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4857  thioesterase superfamily protein  26.19 
 
 		 143 aa  51.2  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0558  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.77 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1215  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  32.12 
 
 		 134 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06649  thioesterase  25.78 
 
 		 150 aa  50.4  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.96 
 
 		 137 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5390  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  30.97 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01695  Predicted thioesterase  26.27 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.431774  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2779  hypothetical protein  30.97 
 
 		 130 aa  48.9  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3064  thioesterase superfamily protein  29.51 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.259385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.24 
 
 		 141 aa  49.3  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2260  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  30.22 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.42219  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0673  putative thioesterase  30.83 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0436073  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2770  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.22 
 
 		 141 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397297  normal  0.706445 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2326  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.83 
 
 		 132 aa  48.9  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.19273 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  29.91 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01606  hypothetical protein  27.93 
 
 		 126 aa  48.5  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3968  thioesterase superfamily protein  22.83 
 
 		 140 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  34.57 
 
 		 138 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02688  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.32 
 
 		 124 aa  47.4  0.00007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00000607478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 136 aa  47  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  27.05 
 
 		 133 aa  47  0.00009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>