153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5234 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
138 aa  284  2.9999999999999996e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  60.14 
 
 
138 aa  178  2e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  54.17 
 
 
155 aa  130  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  40.16 
 
 
136 aa  100  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 
152 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  33.91 
 
 
133 aa  67.4  0.00000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0154  thioesterase superfamily protein  31.25 
 
 
132 aa  66.6  0.00000000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0376255  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4208  thioesterase-like  31.45 
 
 
150 aa  66.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607121  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  31.45 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4363  thioesterase-like protein  31.45 
 
 
150 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02175  hypothetical protein  27.61 
 
 
158 aa  65.1  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.186029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1075  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 
134 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  34.78 
 
 
132 aa  63.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  33.61 
 
 
297 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 
132 aa  61.6  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0158  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 
141 aa  61.6  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0091  hypothetical protein  31.09 
 
 
135 aa  60.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.107179  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2629  thioesterase-like protein  27.61 
 
 
145 aa  60.5  0.000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.293891  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  33.93 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0110  hypothetical protein  30.77 
 
 
138 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.313047  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  33.93 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  33.93 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  33.93 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  33.93 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  33.93 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  33.93 
 
 
132 aa  59.7  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  33.04 
 
 
132 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
NC_002950  PG1543  thioesterase family protein  30.43 
 
 
139 aa  58.2  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1916  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  37 
 
 
128 aa  57.8  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1101  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151637  hitchhiker  0.00000232326 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  27.74 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1151  thioesterase superfamily protein  32.56 
 
 
133 aa  56.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.758431  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0143  thioesterase superfamily protein  29.32 
 
 
138 aa  55.5  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.320461  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3086  thioesterase family protein  29.57 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000112575  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3228  thioesterase superfamily protein  29.57 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2476  thioesterase-like protein  27.69 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.420578  normal  0.586326 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003917  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.05 
 
 
139 aa  53.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0190272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0104  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0454736  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2516  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
139 aa  52.8  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.780106  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0478  thioesterase  27.82 
 
 
167 aa  52.8  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1689  thioesterase family protein  27.82 
 
 
145 aa  52.8  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1224  thioesterase family protein  30.25 
 
 
143 aa  52  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0347226  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2020  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 
176 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2201  thioesterase superfamily protein  37.31 
 
 
132 aa  52  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3047  hypothetical protein  29.57 
 
 
135 aa  52  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1377  hypothetical protein  30.37 
 
 
160 aa  51.2  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.200042  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1366  thioesterase superfamily protein  33.78 
 
 
130 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.974133 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  25.6 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0020  hypothetical protein  25.23 
 
 
181 aa  48.9  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15570  predicted thioesterase  32.46 
 
 
175 aa  48.5  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.509075  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2906  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  27.03 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.15122  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0332  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.3 
 
 
159 aa  47.8  0.00005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1152  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  28.71 
 
 
134 aa  47.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0509  thioesterase superfamily protein  24.59 
 
 
156 aa  47.8  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0969  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.77 
 
 
136 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.475786  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3258  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 
132 aa  47.4  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.26455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0978  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 
131 aa  47.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1090  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30 
 
 
149 aa  47.4  0.00007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  38.96 
 
 
134 aa  47  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.3 
 
 
146 aa  47  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3091  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  26.45 
 
 
134 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.248524  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2118  Pol-Pal system-associated acyl-CoA thioesterase  27.05 
 
 
158 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.296225  normal  0.477442 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  28.81 
 
 
184 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33198  predicted protein  36.84 
 
 
215 aa  46.6  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  28.57 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2872  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.83 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000275881  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2960  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.83 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0218826  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00696  predicted acyl-CoA thioesterase  25.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000730216  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2899  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  25.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252575  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00685  hypothetical protein  25.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00120853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1117  thioesterase superfamily protein  42.62 
 
 
135 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235483  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2648  thioesterase superfamily protein  35.51 
 
 
137 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0313912  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  31.78 
 
 
165 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  26.67 
 
 
159 aa  45.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1894  acyl-CoA thioester hydrolase  31.08 
 
 
134 aa  45.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0789  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000115548  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0765  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133795  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2919  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000323269  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0759  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000767242  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0839  acyl-CoA thioester hydrolase YbgC  25.83 
 
 
134 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000201976  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  31.78 
 
 
160 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  31.78 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  31.78 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  31.78 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  31.78 
 
 
165 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1013  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.25 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.505536  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  29.87 
 
 
135 aa  43.9  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  33.68 
 
 
138 aa  44.3  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 
140 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  39.73 
 
 
134 aa  43.9  0.0007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1703  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 
139 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0741756  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  28.16 
 
 
134 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  28.57 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0376244 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>