70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0476 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  100 
 
 		 297 aa  612  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0477  hypothetical protein  34.58 
 
 		 306 aa  157  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0254  hypothetical protein  32.32 
 
 		 316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.695454  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0592  hypothetical protein  29.66 
 
 		 307 aa  102  1e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2857  thioesterase superfamily protein  31.85 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723517  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  30.43 
 
 		 140 aa  67.8  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0476  thioesterase superfamily protein  33.08 
 
 		 150 aa  64.3  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  29.08 
 
 		 176 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  30.17 
 
 		 179 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  29.63 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 138 aa  62.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  29.57 
 
 		 177 aa  62  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  35.77 
 
 		 138 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 177 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  27.19 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  29.77 
 
 		 144 aa  58.9  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  29.27 
 
 		 159 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 		 148 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  29.08 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  28.69 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  26.96 
 
 		 171 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  31.93 
 
 		 484 aa  54.3  0.000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  32.62 
 
 		 466 aa  53.9  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  26.56 
 
 		 158 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  30.28 
 
 		 171 aa  52  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  33.98 
 
 		 375 aa  50.4  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  27.83 
 
 		 136 aa  50.4  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  30.43 
 
 		 184 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  27.73 
 
 		 158 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  26.83 
 
 		 163 aa  49.7  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  30.17 
 
 		 184 aa  49.3  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  29.93 
 
 		 155 aa  48.9  0.00009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  26.98 
 
 		 156 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  32.22 
 
 		 158 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  31.97 
 
 		 168 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  24.19 
 
 		 164 aa  47.8  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  26.4 
 
 		 160 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  25.78 
 
 		 165 aa  47.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  26.4 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  26.4 
 
 		 160 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  26.4 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  26.4 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  26.4 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  26.4 
 
 		 165 aa  47  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4356  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 152 aa  46.6  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.509436 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  25 
 
 		 169 aa  46.2  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 147 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 147 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  27.48 
 
 		 496 aa  46.2  0.0007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  26.32 
 
 		 147 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  24.8 
 
 		 165 aa  45.8  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 156 aa  45.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  27.2 
 
 		 159 aa  45.4  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  27.05 
 
 		 158 aa  45.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  32.93 
 
 		 165 aa  45.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  25.78 
 
 		 166 aa  45.8  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  26.4 
 
 		 162 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  25.2 
 
 		 158 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  25.6 
 
 		 162 aa  44.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  26.4 
 
 		 162 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  28.91 
 
 		 496 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  26.4 
 
 		 162 aa  43.9  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.55 
 
 		 491 aa  44.3  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  25.22 
 
 		 170 aa  43.9  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  24.19 
 
 		 147 aa  43.5  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1483  thioesterase superfamily protein  21.31 
 
 		 136 aa  42.7  0.007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000203632  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  25.86 
 
 		 156 aa  42.7  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  25.6 
 
 		 162 aa  42.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  25.6 
 
 		 162 aa  42.4  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>