75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0517 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  100 
 
 		 184 aa  380  1e-105  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  79.89 
 
 		 184 aa  307  6.999999999999999e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  58.23 
 
 		 169 aa  206  2e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  53.85 
 
 		 168 aa  192  3e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  52.56 
 
 		 177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  54.49 
 
 		 179 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  51.59 
 
 		 171 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  52.26 
 
 		 176 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  51.92 
 
 		 177 aa  182  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  48.68 
 
 		 164 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  36.05 
 
 		 159 aa  110  1.0000000000000001e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  37.33 
 
 		 169 aa  105  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  37.25 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  37.34 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  37.67 
 
 		 156 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  38.57 
 
 		 496 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  37.41 
 
 		 166 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  35.57 
 
 		 171 aa  98.6  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  36.11 
 
 		 158 aa  97.8  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  36.55 
 
 		 158 aa  97.4  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  36.88 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  35.42 
 
 		 158 aa  95.5  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  34.25 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  34.48 
 
 		 159 aa  94  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  37.33 
 
 		 165 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  36.67 
 
 		 160 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.64 
 
 		 491 aa  93.2  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  34.64 
 
 		 158 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  36.67 
 
 		 160 aa  93.2  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  35.37 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  36.67 
 
 		 165 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  36.67 
 
 		 165 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  36.67 
 
 		 165 aa  93.6  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  36.67 
 
 		 165 aa  93.6  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  37.58 
 
 		 162 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  37.58 
 
 		 162 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  33.55 
 
 		 156 aa  91.3  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.19 
 
 		 375 aa  89.7  2e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  36.94 
 
 		 162 aa  89.4  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  36.88 
 
 		 466 aa  88.6  4e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  32.21 
 
 		 163 aa  88.2  5e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  37.06 
 
 		 154 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  32.03 
 
 		 156 aa  88.2  6e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  37.4 
 
 		 162 aa  87  1e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  30.34 
 
 		 158 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  34.62 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  34.62 
 
 		 162 aa  86.3  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  35.81 
 
 		 162 aa  85.9  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  32.14 
 
 		 496 aa  85.1  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.29 
 
 		 491 aa  84.7  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  33.97 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  32.93 
 
 		 161 aa  83.2  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  28.05 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  28.05 
 
 		 169 aa  79.7  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  35.71 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  29.86 
 
 		 159 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  29.68 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  32.86 
 
 		 496 aa  75.1  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  36.15 
 
 		 175 aa  74.7  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  32.77 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  36.89 
 
 		 150 aa  68.2  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  31.65 
 
 		 484 aa  65.5  0.0000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  31.54 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  27.97 
 
 		 165 aa  63.5  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  30.17 
 
 		 297 aa  49.3  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 138 aa  48.5  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  29.92 
 
 		 143 aa  44.3  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  25.2 
 
 		 157 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 140 aa  43.1  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 138 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 151 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  29.13 
 
 		 143 aa  42.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  27.06 
 
 		 136 aa  42.7  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.02 
 
 		 130 aa  42  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  23.24 
 
 		 179 aa  41.2  0.008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>