263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_3842 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_3842  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 157 aa  322  1e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.601909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1644  thioesterase superfamily protein  90.67 
 
 		 151 aa  280  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4476  thioesterase superfamily protein  84.4 
 
 		 142 aa  253  9e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474208  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5551  putative thioesterase  68.92 
 
 		 154 aa  221  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.427628 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  39.73 
 
 		 148 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3305  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 147 aa  118  3e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3629  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 147 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3477  thioesterase superfamily protein  41.09 
 
 		 144 aa  112  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.288335  normal  0.350284 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2619  thioesterase superfamily protein  37.59 
 
 		 140 aa  103  6e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2608  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 141 aa  98.6  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.331669 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  41.07 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2347  thioesterase superfamily protein  33.07 
 
 		 132 aa  72.8  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.754827  normal  0.0192186 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0036  thioesterase superfamily protein  35.48 
 
 		 139 aa  72  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0244  thioesterase superfamily protein  34.06 
 
 		 163 aa  72  0.000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.758642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3156  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0426  thioesterase superfamily protein  34.04 
 
 		 155 aa  69.3  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4436  hypothetical protein  32.84 
 
 		 158 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1769  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201031  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  33.59 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  27.48 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1465  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 136 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  29.01 
 
 		 145 aa  64.7  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2050  hypothetical protein  33.91 
 
 		 150 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110893  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2225  thioesterase family protein  32 
 
 		 135 aa  64.3  0.0000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.713271  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2820  hypothetical protein  30 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.132561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0277  thioesterase superfamily protein  31.54 
 
 		 143 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872113 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 142 aa  63.9  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4557  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 145 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.215777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2654  thioesterase family protein  32.09 
 
 		 203 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3014  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.80515  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1213  thioesterase superfamily protein  31.47 
 
 		 150 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00301171  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3691  thioesterase superfamily protein  33.91 
 
 		 150 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  29.13 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0931  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  29.13 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1413  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 145 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.236272  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  29.13 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2141  thioesterase superfamily protein  31.93 
 
 		 164 aa  62  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000000226869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1391  thioesterase superfamily protein  33.06 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243667 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3704  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  35.56 
 
 		 156 aa  61.6  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3395  thioesterase superfamily protein  30.88 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.435542  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3287  thioesterase superfamily protein  27.97 
 
 		 140 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0335707  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  33.61 
 
 		 138 aa  61.2  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3586  thioesterase superfamily protein  30.66 
 
 		 153 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.764117  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1367  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 162 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000075245  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4309  thioesterase superfamily protein  28.91 
 
 		 156 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.515868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  32 
 
 		 155 aa  60.1  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0966  thioesterase superfamily protein  31.4 
 
 		 145 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1681  putative Thioesterase/thiol ester dehydrase-isomerase  32.56 
 
 		 163 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10124  normal  0.0917493 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1317  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  32.31 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2415  thioesterase superfamily protein  27.78 
 
 		 136 aa  59.3  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.334268  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1293  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 145 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.263092  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2066  thioesterase superfamily protein  32.77 
 
 		 160 aa  59.3  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  hitchhiker  0.00365834 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0662  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1332  thioesterase superfamily protein  32.23 
 
 		 145 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0269982  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3308  thioesterase superfamily protein  33.83 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.362677  normal  0.831787 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2493  thioesterase superfamily protein  31.2 
 
 		 162 aa  58.9  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0808355  normal  0.025023 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1202  thioesterase superfamily protein  35.65 
 
 		 175 aa  58.5  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000375293  normal  0.571615 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  29.69 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  32.2 
 
 		 139 aa  58.2  0.00000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1608  thioesterase superfamily protein  29.37 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2680  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1267  thioesterase superfamily protein  32 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.384152  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3086  thioesterase superfamily protein  30 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00000791205  normal  0.0550819 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1670  thioesterase family protein  30.47 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.895942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1824  thioesterase family protein  30.47 
 
 		 181 aa  57.4  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.814646  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2748  thioesterase superfamily protein  31.01 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.381666  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2836  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1678  thioesterase superfamily protein  29.27 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.71411 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1648  thioesterase family protein  30.47 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129475  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0719  thioesterase family protein  30.47 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0443  thioesterase family protein  30.47 
 
 		 149 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1437  thioesterase family protein  30.47 
 
 		 181 aa  57  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0815  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.545456  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  32.09 
 
 		 147 aa  57  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3772  thioesterase superfamily protein  27.91 
 
 		 142 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.478707  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0906  thioesterase family protein  30.83 
 
 		 125 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.661315  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1863  thioesterase  27.56 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  31.36 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  27.64 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1210  thioesterase superfamily protein  28.93 
 
 		 134 aa  56.2  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000686795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  23.21 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2677  thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0092  hypothetical protein  25.95 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1565  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0981  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1463  thioesterase superfamily protein  32.54 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1855  hypothetical protein  25.81 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.087646  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1937  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 136 aa  55.1  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00538677  normal  0.170289 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2819  thioesterase superfamily protein  28.99 
 
 		 149 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.453856  normal  0.118463 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1364  putative thioesterase  31.2 
 
 		 134 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1348  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1388  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4608  thioesterase superfamily protein  31.78 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00844353  normal  0.865959 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4741  thioesterase superfamily protein  28.12 
 
 		 153 aa  54.7  0.0000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0117203  normal  0.418796 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 147 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>