65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1939 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  331  2e-90  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  52.23 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  52.23 
 
 		 169 aa  174  4e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  37.76 
 
 		 158 aa  109  1.0000000000000001e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  36.94 
 
 		 162 aa  103  8e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  33.33 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  34.25 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  32.39 
 
 		 168 aa  90.9  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  31.61 
 
 		 156 aa  87.4  7e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  32.21 
 
 		 164 aa  85.9  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  33.8 
 
 		 168 aa  85.5  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  30.97 
 
 		 156 aa  85.1  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  32.32 
 
 		 175 aa  84  8e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  30.97 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  30.07 
 
 		 158 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  32.87 
 
 		 184 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  34.27 
 
 		 176 aa  82  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  29.73 
 
 		 169 aa  81.3  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  28.87 
 
 		 159 aa  80.9  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  30.41 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  32.26 
 
 		 158 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  30.14 
 
 		 166 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  28.85 
 
 		 159 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  30 
 
 		 163 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  30.57 
 
 		 158 aa  77.4  0.00000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  29.08 
 
 		 162 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  28.67 
 
 		 158 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  29.05 
 
 		 160 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  28.87 
 
 		 177 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  29.05 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  29.05 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  28.67 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  29.08 
 
 		 162 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  29.68 
 
 		 184 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  29.05 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  29.05 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  29.87 
 
 		 165 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  28.67 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  28.67 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  29.05 
 
 		 160 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  28.21 
 
 		 159 aa  74.7  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  29.45 
 
 		 165 aa  74.3  0.0000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  30.99 
 
 		 169 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 177 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  32 
 
 		 159 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  30.07 
 
 		 179 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  27.97 
 
 		 162 aa  72  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  26.95 
 
 		 162 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  30.77 
 
 		 171 aa  69.7  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  29.71 
 
 		 496 aa  68.2  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  26.67 
 
 		 375 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  28.45 
 
 		 154 aa  62  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  27.78 
 
 		 144 aa  61.2  0.000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  26.76 
 
 		 491 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  30.5 
 
 		 484 aa  58.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  26.97 
 
 		 491 aa  57  0.0000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  28.78 
 
 		 496 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  31.3 
 
 		 391 aa  55.1  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  26.35 
 
 		 466 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  28.18 
 
 		 171 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  27.33 
 
 		 496 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  30.93 
 
 		 165 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  25 
 
 		 170 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  22.63 
 
 		 179 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>