83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3365 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  100 
 
 		 179 aa  369  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  81.56 
 
 		 177 aa  305  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  82.74 
 
 		 177 aa  294  6e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  78.62 
 
 		 176 aa  277  7e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  74.21 
 
 		 168 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  75.16 
 
 		 171 aa  260  6.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  55.13 
 
 		 184 aa  190  7e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  53.85 
 
 		 169 aa  187  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  54.49 
 
 		 184 aa  186  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  48.47 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  41.5 
 
 		 158 aa  125  3e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  41.5 
 
 		 158 aa  120  8e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  37.16 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  39.86 
 
 		 159 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  39.19 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  38.46 
 
 		 171 aa  115  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  40.94 
 
 		 158 aa  114  6e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  39.22 
 
 		 491 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  43.45 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  43.45 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  43.45 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  43.45 
 
 		 165 aa  111  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  43.45 
 
 		 165 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  43.45 
 
 		 160 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  34.84 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  38.93 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  36.3 
 
 		 156 aa  108  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  42.76 
 
 		 160 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  42 
 
 		 162 aa  106  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  37.24 
 
 		 156 aa  106  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  37.18 
 
 		 166 aa  105  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  41.33 
 
 		 162 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  42.07 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  41.33 
 
 		 162 aa  105  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  38.46 
 
 		 169 aa  105  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  37.84 
 
 		 158 aa  105  5e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  35.26 
 
 		 496 aa  104  9e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  40.67 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  40.67 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  40.67 
 
 		 162 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  38.26 
 
 		 162 aa  102  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  37.5 
 
 		 496 aa  101  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  34.78 
 
 		 165 aa  101  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  35.62 
 
 		 156 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  36.43 
 
 		 168 aa  99.8  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.76 
 
 		 496 aa  98.2  5e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.19 
 
 		 375 aa  97.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  33.54 
 
 		 163 aa  95.1  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.75 
 
 		 466 aa  94  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  35.62 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  34.12 
 
 		 175 aa  91.7  5e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  38.97 
 
 		 154 aa  90.9  9e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  33.89 
 
 		 484 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.03 
 
 		 491 aa  89.4  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  33.79 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  33.78 
 
 		 161 aa  87  1e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  33.79 
 
 		 169 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  37.87 
 
 		 391 aa  87.4  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  35.97 
 
 		 144 aa  86.3  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  33.11 
 
 		 162 aa  84  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  37.5 
 
 		 150 aa  81.6  0.000000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  30.07 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  32.79 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  33.09 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  30.17 
 
 		 297 aa  64.3  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  27.82 
 
 		 138 aa  48.9  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 138 aa  45.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  28.1 
 
 		 143 aa  45.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0254  hypothetical protein  27.83 
 
 		 316 aa  45.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.695454  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  28.1 
 
 		 143 aa  45.1  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  23.66 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  26.5 
 
 		 147 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  28.93 
 
 		 151 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  24.59 
 
 		 139 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2857  thioesterase superfamily protein  24.24 
 
 		 139 aa  43.5  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723517  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  24.8 
 
 		 130 aa  42.7  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0191  thioesterase superfamily protein  31.67 
 
 		 140 aa  42  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  24.62 
 
 		 156 aa  42.4  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1939  thioesterase superfamily protein  29.73 
 
 		 145 aa  41.6  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07490  predicted thioesterase  30.91 
 
 		 155 aa  41.2  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.736623 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1644  thioesterase superfamily protein  24.06 
 
 		 148 aa  41.2  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>