68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0301 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  100 
 
 		 156 aa  325  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  80.13 
 
 		 156 aa  269  1e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  80.77 
 
 		 156 aa  265  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  82.69 
 
 		 158 aa  259  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  67.74 
 
 		 158 aa  217  5e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  62.82 
 
 		 158 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  59.48 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  60.13 
 
 		 159 aa  185  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  56.21 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  56.21 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  56.21 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  56.21 
 
 		 165 aa  176  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  56.21 
 
 		 160 aa  176  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  56.21 
 
 		 160 aa  175  2e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  55.56 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  54.9 
 
 		 165 aa  175  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  57.24 
 
 		 158 aa  174  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  56.86 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  56.86 
 
 		 162 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  56.86 
 
 		 162 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  54.9 
 
 		 162 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  55.56 
 
 		 162 aa  169  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  54.9 
 
 		 162 aa  167  6e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  54.9 
 
 		 162 aa  166  8e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  53.29 
 
 		 163 aa  165  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  52.6 
 
 		 166 aa  163  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  51.3 
 
 		 169 aa  157  7e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  50.64 
 
 		 165 aa  148  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  43.59 
 
 		 159 aa  140  6e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  40.69 
 
 		 158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  40.13 
 
 		 144 aa  115  1.9999999999999998e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  40.69 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  47.29 
 
 		 150 aa  111  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  36.6 
 
 		 169 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  36.3 
 
 		 179 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  42.18 
 
 		 161 aa  108  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  36.99 
 
 		 176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  40.13 
 
 		 491 aa  106  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  35.62 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  33.99 
 
 		 177 aa  105  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  36.11 
 
 		 164 aa  103  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  37.5 
 
 		 496 aa  102  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  38.19 
 
 		 496 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  37.84 
 
 		 165 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  37.5 
 
 		 496 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  38.21 
 
 		 154 aa  97.8  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  34.59 
 
 		 175 aa  98.2  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  35.1 
 
 		 159 aa  97.8  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  40.67 
 
 		 484 aa  97.4  6e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  39.86 
 
 		 466 aa  97.4  7e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  33.56 
 
 		 171 aa  97.1  9e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  46.67 
 
 		 491 aa  94.7  4e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  31.03 
 
 		 168 aa  92  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  32.24 
 
 		 184 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.53 
 
 		 375 aa  91.7  3e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  32.67 
 
 		 162 aa  88.2  4e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  32.03 
 
 		 184 aa  88.2  4e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  41.59 
 
 		 391 aa  87.8  5e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  30.97 
 
 		 158 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  30.77 
 
 		 169 aa  75.9  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  34.78 
 
 		 168 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  28.46 
 
 		 171 aa  61.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  26.98 
 
 		 297 aa  48.9  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  22.95 
 
 		 170 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  28.05 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  26.89 
 
 		 135 aa  42.4  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>