55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1848 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 140 aa  282  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 		 148 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  30.43 
 
 		 297 aa  67.8  0.00000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2857  thioesterase superfamily protein  28.06 
 
 		 139 aa  63.5  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723517  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0476  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 150 aa  60.1  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0477  hypothetical protein  27.34 
 
 		 306 aa  52  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0777  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 137 aa  52  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 137 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0740  thioesterase superfamily protein  26.88 
 
 		 137 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0509002  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0777  thioesterase superfamily protein  23.91 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.311039  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  32.26 
 
 		 140 aa  50.4  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3016  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.396701 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3323  thioesterase superfamily protein  30.08 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  31.15 
 
 		 140 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  24.39 
 
 		 143 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  30.58 
 
 		 140 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  21.88 
 
 		 164 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  24.22 
 
 		 177 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  30.63 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.1 
 
 		 375 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1411  thioesterase superfamily protein  29.6 
 
 		 148 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04892  putative thioesterase  25.62 
 
 		 134 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  27.83 
 
 		 156 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2192  thioesterase superfamily protein  32.22 
 
 		 152 aa  45.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.947686  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1421  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.77 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00518151  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4621  thioesterase superfamily protein  29.5 
 
 		 145 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.921901  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3272  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 149 aa  43.5  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.96014  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  26.23 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  26.53 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  31.48 
 
 		 153 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  27.83 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  26.72 
 
 		 184 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0093  NH(3)-dependent NAD(+) synthetase  26.98 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0174825  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1512  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase protein  27.12 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  27.83 
 
 		 158 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  25.95 
 
 		 184 aa  42.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1054  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 132 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34330  Thioesterase superfamily protein  28.03 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.637312  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  31.03 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  30.34 
 
 		 466 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1579  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 134 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.745479  normal  0.0986216 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4640  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 132 aa  42  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  hitchhiker  0.00279104 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  24.27 
 
 		 158 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1611  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0525726  normal  0.904244 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2925  hypothetical protein  24.79 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1939  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.158219  hitchhiker  0.00402541 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03521  thioesterase  21.43 
 
 		 148 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  20.59 
 
 		 168 aa  40.8  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27301  thioesterase  25.66 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.91787 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1882  thioesterase superfamily protein  27.35 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  23.58 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2835  thioesterase superfamily protein  29.41 
 
 		 142 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3415  thioesterase superfamily protein  27.56 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7090  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  24.41 
 
 		 139 aa  40  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>