39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4823 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  100 
 
 
148 aa  303  4.0000000000000004e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0476  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 
150 aa  90.5  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  35.29 
 
 
145 aa  88.2  4e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  34.07 
 
 
140 aa  78.6  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2857  thioesterase superfamily protein  38.4 
 
 
139 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723517  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  25.98 
 
 
297 aa  56.6  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  30.3 
 
 
147 aa  50.4  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0477  hypothetical protein  27.01 
 
 
306 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1807  thioesterase superfamily protein  30.77 
 
 
138 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  26.98 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  22.6 
 
 
168 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00219  thioesterase family protein  27.2 
 
 
139 aa  47.4  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 
143 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  27.41 
 
 
154 aa  47  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0715  hypothetical protein  28.32 
 
 
136 aa  45.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6462  thioesterase superfamily protein  28.87 
 
 
151 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  27.42 
 
 
132 aa  45.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1601  thioesterase superfamily protein  25.42 
 
 
137 aa  45.4  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812398  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2560  hypothetical protein  30.99 
 
 
181 aa  45.1  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  24.66 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  24.32 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  26.43 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3556  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31.82 
 
 
137 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0792097  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3245  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.14 
 
 
145 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.398056  normal  0.585134 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4320  thioesterase superfamily protein  32.91 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1881  thioesterase superfamily protein  25.98 
 
 
153 aa  42  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  25.33 
 
 
171 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0209  thioesterase superfamily protein  26.67 
 
 
133 aa  41.2  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.873249 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2027  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  27.87 
 
 
141 aa  41.2  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  28.33 
 
 
132 aa  40.4  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  26.79 
 
 
484 aa  40.4  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  23.28 
 
 
168 aa  40.4  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  24.07 
 
 
138 aa  40.8  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>