18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0476 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0476  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 150 aa  308  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2857  thioesterase superfamily protein  36.64 
 
 		 139 aa  90.9  5e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  39.67 
 
 		 148 aa  90.5  6e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  42.36 
 
 		 145 aa  90.9  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  33.08 
 
 		 297 aa  64.3  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  29.13 
 
 		 140 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1614  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 149 aa  46.2  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4208  thioesterase-like  29.36 
 
 		 150 aa  45.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0607121  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  27.54 
 
 		 171 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0505  thioesterase superfamily protein  26.09 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4363  thioesterase-like protein  29.36 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4340  thioesterase-like protein  29.36 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.408761  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0477  hypothetical protein  24.37 
 
 		 306 aa  43.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0254  hypothetical protein  26.15 
 
 		 316 aa  43.1  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.695454  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3505  hypothetical protein  27.36 
 
 		 133 aa  42  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.890214 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0821  thioesterase superfamily protein  31.71 
 
 		 132 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3983  thioesterase superfamily protein  25.45 
 
 		 139 aa  40.4  0.009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.813194  normal  0.0353277 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1898  thioesterase superfamily protein  24.27 
 
 		 140 aa  40.4  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.292723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>