79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2737 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  357  3e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  78.34 
 
 		 176 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  78.06 
 
 		 177 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  75.16 
 
 		 179 aa  260  6e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  72.9 
 
 		 168 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  72.9 
 
 		 177 aa  249  1e-65  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  51.59 
 
 		 184 aa  185  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  52.9 
 
 		 169 aa  184  6e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  51.59 
 
 		 184 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  48.72 
 
 		 164 aa  168  4e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  35.57 
 
 		 159 aa  117  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  41.1 
 
 		 158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  37.41 
 
 		 158 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  39.46 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  35.53 
 
 		 159 aa  107  6e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  35.57 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.15 
 
 		 496 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  36.05 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  41.1 
 
 		 158 aa  104  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  35.17 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  34.16 
 
 		 169 aa  104  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  34.57 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.15 
 
 		 496 aa  102  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  34.93 
 
 		 156 aa  97.8  7e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  33.56 
 
 		 156 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  35.66 
 
 		 168 aa  97.1  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  33.12 
 
 		 163 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  32.5 
 
 		 491 aa  97.1  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  34.25 
 
 		 156 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  36.49 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  36.49 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  36.49 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  36.49 
 
 		 165 aa  95.9  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  34.97 
 
 		 375 aa  95.5  3e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  36.49 
 
 		 165 aa  95.9  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  33.54 
 
 		 496 aa  94.7  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  35.14 
 
 		 165 aa  94  9e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  34.25 
 
 		 158 aa  93.6  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  34.46 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  33.54 
 
 		 165 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  33.11 
 
 		 162 aa  92.4  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  34.46 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  34.46 
 
 		 162 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  33.78 
 
 		 162 aa  91.7  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  35.57 
 
 		 162 aa  91.3  5e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  33.78 
 
 		 162 aa  91.3  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  38.4 
 
 		 154 aa  88.6  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  31.33 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  33.8 
 
 		 466 aa  84.3  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  32.24 
 
 		 491 aa  82.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  36.67 
 
 		 150 aa  81.3  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  31.97 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  31.97 
 
 		 169 aa  80.9  0.000000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  32.08 
 
 		 391 aa  80.5  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  31.76 
 
 		 161 aa  79.3  0.00000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  28.28 
 
 		 159 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  34.15 
 
 		 144 aa  75.9  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  35.66 
 
 		 175 aa  74.3  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  31.78 
 
 		 484 aa  73.9  0.0000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  30.77 
 
 		 158 aa  69.7  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  33.62 
 
 		 170 aa  68.9  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  30.56 
 
 		 165 aa  64.3  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  26.96 
 
 		 297 aa  55.5  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  27.64 
 
 		 138 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1529  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  31 
 
 		 146 aa  48.1  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.624218  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3994  thioesterase superfamily protein  32.06 
 
 		 143 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3262  putative thioesterase  30.87 
 
 		 143 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.849103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2464  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  31.4 
 
 		 138 aa  43.9  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0395895  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0476  thioesterase superfamily protein  27.54 
 
 		 150 aa  43.9  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  25.87 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  25.33 
 
 		 148 aa  42  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  23.36 
 
 		 145 aa  42  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0102  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 147 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.208156 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0121  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 147 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.750457  normal  0.0163891 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0112  thioesterase superfamily protein  28.68 
 
 		 147 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10164  hypothetical protein  28.1 
 
 		 151 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5175  thioesterase superfamily protein  24.17 
 
 		 139 aa  41.2  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.641217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>