71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1423 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  100 
 
 
169 aa  348  2e-95  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  58.93 
 
 
184 aa  209  2e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  58.23 
 
 
184 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  52.69 
 
 
177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  53.12 
 
 
168 aa  191  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  53.85 
 
 
177 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  53.85 
 
 
179 aa  187  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  54.84 
 
 
176 aa  187  8e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  52.9 
 
 
171 aa  184  6e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  44.52 
 
 
164 aa  154  6e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  40.65 
 
 
159 aa  120  7e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  45.95 
 
 
160 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  45.95 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  45.95 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  45.95 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  45.95 
 
 
165 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  45.95 
 
 
165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  45.95 
 
 
160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  44.59 
 
 
165 aa  118  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  42.18 
 
 
169 aa  115  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  42.96 
 
 
171 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  42.47 
 
 
166 aa  114  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  40.85 
 
 
159 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  40.82 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  41.55 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  39.73 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  40.41 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  37.76 
 
 
158 aa  112  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  40.14 
 
 
159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  41.89 
 
 
162 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  41.89 
 
 
162 aa  111  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  41.89 
 
 
162 aa  111  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  40.28 
 
 
168 aa  110  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  41.22 
 
 
162 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  36.6 
 
 
156 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  36.81 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  39.86 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  41.22 
 
 
162 aa  108  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  39.16 
 
 
496 aa  108  4.0000000000000004e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  37.25 
 
 
491 aa  107  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  39.62 
 
 
165 aa  107  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  35.29 
 
 
156 aa  107  1e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  40.54 
 
 
162 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  39.16 
 
 
496 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  38.1 
 
 
163 aa  103  9e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  38.75 
 
 
375 aa  101  4e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  36.62 
 
 
158 aa  99.8  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  42.66 
 
 
496 aa  99  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  33.1 
 
 
159 aa  98.2  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  38.24 
 
 
466 aa  96.7  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  37.76 
 
 
154 aa  95.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  38.46 
 
 
144 aa  92.8  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  35.03 
 
 
161 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  32.3 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  32.3 
 
 
169 aa  87.4  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  31.08 
 
 
162 aa  85.5  3e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  38.98 
 
 
391 aa  83.6  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  31.33 
 
 
175 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  34.53 
 
 
491 aa  82  0.000000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  36.22 
 
 
170 aa  79  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  40.35 
 
 
150 aa  78.6  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  35.48 
 
 
484 aa  77.4  0.00000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  30.99 
 
 
158 aa  73.6  0.000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  32.12 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  28.06 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0254  hypothetical protein  26.96 
 
 
316 aa  47.4  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.695454  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1780  thioesterase superfamily protein  30 
 
 
138 aa  47.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0496186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  25 
 
 
297 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3106  thioesterase superfamily protein  25.35 
 
 
156 aa  42  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.346336  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5234  thioesterase superfamily protein  26.36 
 
 
138 aa  40.8  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  25 
 
 
145 aa  40.8  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>