16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0254 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0254  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  635    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.695454  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0592  hypothetical protein  43.09 
 
 		 307 aa  224  1e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997062 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0477  hypothetical protein  39.22 
 
 		 306 aa  171  1e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  32.32 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  28.79 
 
 		 496 aa  49.7  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  30 
 
 		 176 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  27.52 
 
 		 168 aa  48.9  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  26.96 
 
 		 169 aa  47.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  26.36 
 
 		 177 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  27.83 
 
 		 179 aa  45.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  27.83 
 
 		 144 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  27.27 
 
 		 159 aa  45.1  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 177 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0476  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 150 aa  43.1  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  26.52 
 
 		 164 aa  43.1  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  30.08 
 
 		 171 aa  42.4  0.01  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>