41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0477 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0477  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  627  1e-179  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0254  hypothetical protein  39.22 
 
 		 316 aa  202  8e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.695454  normal  0.141517 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  34.58 
 
 		 297 aa  181  9.000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0592  hypothetical protein  31.8 
 
 		 307 aa  149  7e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00997062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2857  thioesterase superfamily protein  29.03 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.723517  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  30.53 
 
 		 176 aa  55.1  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  26.32 
 
 		 169 aa  52.8  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  27.34 
 
 		 140 aa  52.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  25.56 
 
 		 177 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  25.56 
 
 		 177 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  34.35 
 
 		 171 aa  50.1  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4823  thioesterase superfamily protein  27.01 
 
 		 148 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.855952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  24.81 
 
 		 168 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  26.32 
 
 		 179 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1624  thioesterase superfamily protein  28.79 
 
 		 143 aa  47.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  27.64 
 
 		 170 aa  46.6  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  22.73 
 
 		 171 aa  46.2  0.0007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0494  thioesterase superfamily protein  31.13 
 
 		 132 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0326  hypothetical protein  30.12 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0503  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.159838 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0557  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1586  hypothetical protein  30.12 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.689627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0513  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.116803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1040  hypothetical protein  30.12 
 
 		 135 aa  44.7  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0496  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 132 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2550  thioesterase superfamily protein  25.71 
 
 		 149 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  30.21 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0910  thioesterase superfamily protein  32.88 
 
 		 132 aa  43.5  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.756166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  28.1 
 
 		 145 aa  42.7  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0476  thioesterase superfamily protein  24.37 
 
 		 150 aa  42.7  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1856  hypothetical protein  32.05 
 
 		 129 aa  42.7  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.301656 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0486  thioesterase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  42.4  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00849575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0366  thioesterase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  42.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.356358  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3189  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 132 aa  42.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.590912  normal  0.0179744 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0479  thioesterase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  42.4  0.009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0624989  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0520  thioesterase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  42.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00162473  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2882  thioesterase superfamily protein  24.64 
 
 		 149 aa  42.4  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00000187556  decreased coverage  0.00358104 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00399  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  42.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.681149  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3166  thioesterase superfamily protein  30.95 
 
 		 132 aa  42.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.118227  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00395  hypothetical protein  30.95 
 
 		 132 aa  42.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.616118  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0529  thioesterase family protein  30.95 
 
 		 132 aa  42.4  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.107465  normal  0.895725 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>