65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4150 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  351  2.9999999999999997e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  39.13 
 
 		 179 aa  132  3e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  36.22 
 
 		 169 aa  79  0.00000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  33.33 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  33.61 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  33.64 
 
 		 164 aa  74.7  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  33.6 
 
 		 177 aa  74.7  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  32.79 
 
 		 179 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  33.77 
 
 		 466 aa  73.2  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  33.57 
 
 		 184 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  31.5 
 
 		 168 aa  70.1  0.00000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  33.62 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  30.72 
 
 		 158 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  31.54 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  28.68 
 
 		 159 aa  60.8  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  29.06 
 
 		 159 aa  58.9  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  24.83 
 
 		 156 aa  58.5  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  24.58 
 
 		 158 aa  58.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  25.42 
 
 		 158 aa  57.4  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  32 
 
 		 162 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  30.25 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  30.95 
 
 		 168 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  27.54 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  31.2 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  31.2 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  30.4 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  31.2 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  25.83 
 
 		 154 aa  53.5  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  26.09 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  24.34 
 
 		 163 aa  53.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  27.48 
 
 		 496 aa  52  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  27.07 
 
 		 491 aa  51.6  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  24.14 
 
 		 158 aa  51.6  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  28.46 
 
 		 162 aa  51.6  0.000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  26.98 
 
 		 161 aa  50.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  26.21 
 
 		 166 aa  50.1  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  24.66 
 
 		 159 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  26.21 
 
 		 169 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  27.27 
 
 		 158 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  25.64 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  24 
 
 		 484 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  21.74 
 
 		 156 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  26.72 
 
 		 160 aa  47.8  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  26.72 
 
 		 160 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0477  hypothetical protein  27.64 
 
 		 306 aa  46.6  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  29.51 
 
 		 165 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  22.95 
 
 		 156 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  25.86 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  24.79 
 
 		 496 aa  44.3  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3072  thioesterase-like protein  30 
 
 		 145 aa  44.3  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  26.45 
 
 		 144 aa  44.3  0.0008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  25.22 
 
 		 297 aa  43.9  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  26.36 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  25 
 
 		 158 aa  43.5  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  25.2 
 
 		 496 aa  41.6  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  25.51 
 
 		 491 aa  41.2  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  27.42 
 
 		 159 aa  41.2  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  22.06 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  22.06 
 
 		 169 aa  40.8  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  26.36 
 
 		 391 aa  40.8  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.727578 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>