41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4140 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  39.13 
 
 		 170 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  30.56 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  30.61 
 
 		 466 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  27.06 
 
 		 491 aa  61.2  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  28.06 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  26.67 
 
 		 496 aa  53.9  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  26.32 
 
 		 168 aa  53.1  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  28.93 
 
 		 375 aa  52  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  23.87 
 
 		 156 aa  51.2  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  22.3 
 
 		 158 aa  50.8  0.000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  26.11 
 
 		 496 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  22 
 
 		 158 aa  50.4  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  26.57 
 
 		 166 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  26.09 
 
 		 159 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  21.53 
 
 		 164 aa  50.1  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  22 
 
 		 158 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  29.91 
 
 		 484 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  26 
 
 		 491 aa  48.5  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  22.92 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  25.3 
 
 		 169 aa  47.8  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  29.14 
 
 		 168 aa  47.8  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  25.17 
 
 		 158 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  23.66 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  25.17 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  25.58 
 
 		 158 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  24.49 
 
 		 161 aa  45.4  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  22.48 
 
 		 159 aa  45.4  0.0005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  26.02 
 
 		 496 aa  45.1  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  23.66 
 
 		 179 aa  45.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  24.5 
 
 		 159 aa  44.3  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  28.05 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  22.95 
 
 		 175 aa  43.1  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  33.75 
 
 		 154 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  22.56 
 
 		 163 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  25.87 
 
 		 171 aa  42.7  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  22.63 
 
 		 158 aa  42.4  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  24.39 
 
 		 158 aa  42  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  26.36 
 
 		 391 aa  41.6  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  22.3 
 
 		 156 aa  41.2  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  23.24 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>