68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0325 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0325  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  324  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0321  hypothetical protein  83.33 
 
 		 156 aa  275  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.163836 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0301  hypothetical protein  82.69 
 
 		 156 aa  270  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.569297  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4907  hypothetical protein  82.05 
 
 		 156 aa  270  6e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0583702 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5233  hypothetical protein  66.46 
 
 		 158 aa  222  2e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0215792 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2919  hypothetical protein  63.92 
 
 		 158 aa  204  6e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.30598  normal  0.266429 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71120  hypothetical protein  60.9 
 
 		 159 aa  194  5.000000000000001e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.84981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6171  hypothetical protein  60.9 
 
 		 159 aa  191  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0502  thioesterase-like protein  56.77 
 
 		 158 aa  178  2e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0984  hypothetical protein  54.84 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.757206  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0688  hypothetical protein  54.84 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0853  hypothetical protein  54.84 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1956  hypothetical protein  54.84 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2131  hypothetical protein  54.84 
 
 		 160 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1846  thioesterase, putative  54.19 
 
 		 165 aa  172  9.999999999999999e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0493  hypothetical protein  54.84 
 
 		 160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0763  hypothetical protein  54.19 
 
 		 165 aa  172  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288362  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0825  hypothetical protein  54.19 
 
 		 166 aa  171  3.9999999999999995e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.493019 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4507  hypothetical protein  54.55 
 
 		 169 aa  168  3e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5235  thioesterase-like protein  53.85 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5049  thioesterase-like protein  53.85 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.488761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4457  thioesterase-like protein  54.49 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0730992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3318  thioesterase-like  53.85 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0744427  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0614  thioesterase-like  52.56 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4977  thioesterase-like protein  54.49 
 
 		 162 aa  166  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.603539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3591  thioesterase-like protein  53.21 
 
 		 162 aa  164  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.479418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3283  hypothetical protein  50.66 
 
 		 163 aa  164  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3966  thioesterase-like protein  51.57 
 
 		 165 aa  157  4e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.247179 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0346  hypothetical protein  44.23 
 
 		 159 aa  143  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16240  predicted thioesterase  40.79 
 
 		 144 aa  117  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1423  hypothetical protein  39.73 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.295066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4019  conserved hypothetical protein; putative thioesterase superfamily  37.84 
 
 		 177 aa  114  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.322437  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1342  thioesterase superfamily protein  47.29 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3277  hypothetical protein  38.26 
 
 		 176 aa  111  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.567089  normal  0.787779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3365  thioesterase-like  37.84 
 
 		 179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.736956  hitchhiker  0.00851583 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0769  hypothetical protein  38.19 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3172  hypothetical protein  42.18 
 
 		 161 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0385  hypothetical protein  39.58 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2186  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  41.45 
 
 		 491 aa  108  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2025  thioesterase superfamily protein  34.84 
 
 		 177 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.310445  normal  0.126574 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6305  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  39.19 
 
 		 165 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2438  hypothetical protein  34.78 
 
 		 164 aa  104  6e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.395574  normal  0.244804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2923  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  40.71 
 
 		 491 aa  103  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0730038  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2034  hypothetical protein  35.53 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.773623  hitchhiker  0.00902465 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4493  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  45.3 
 
 		 496 aa  101  4e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.733703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5042  hypothetical protein  36 
 
 		 154 aa  100  7e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.119922  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6430  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  44.35 
 
 		 496 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.93663  normal  0.0295637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6134  hypothetical protein  34.48 
 
 		 168 aa  100  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0376244 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2737  hypothetical protein  34.25 
 
 		 171 aa  99.4  2e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2174  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  36.62 
 
 		 496 aa  98.6  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3827  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  41.22 
 
 		 466 aa  99  3e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0517  hypothetical protein  34.64 
 
 		 184 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7697  thioesterase-like  33.11 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.479271 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5073  bifunctional 3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase/thioesterase  43.8 
 
 		 484 aa  94.4  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.459353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3141  lipolytic enzyme, G-D-S-L  41.96 
 
 		 375 aa  93.6  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.395324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1019  hypothetical protein  39.32 
 
 		 175 aa  92.4  2e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0102733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2825  hypothetical protein  41.59 
 
 		 391 aa  89.4  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.727578 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1939  hypothetical protein  31.21 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2359  hypothetical protein  29.94 
 
 		 162 aa  82.4  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2741  thioesterase, FcbC-like  33.11 
 
 		 168 aa  81.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0763545 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2418  hypothetical protein  29.49 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2372  hypothetical protein  29.49 
 
 		 169 aa  70.9  0.000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5440  hypothetical protein  29.27 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.651867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4150  hypothetical protein  25.37 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.216159  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0476  thioesterase-like protein  27.73 
 
 		 297 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4140  hypothetical protein  21.68 
 
 		 179 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1133  thioesterase superfamily protein  26.61 
 
 		 135 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1848  thioesterase superfamily protein  27.83 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.149836  normal  0.418825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>